岛上有菩提树等珍贵人工种植树种，由石英岩、粉砂岩、页岩和泥灰岩等组成，因复杂的地质构造影响，形成奇特的地貌。东侧岩层重叠，陡峭如壁。其余各侧陡坡断崖形态各异，中部地表土层较厚，茅草丛生，间有槐、榆、松树，南部有自然景观一线天、马鞍桥、虎陷洞，北部有花岗岩石结构的三清阁、五官宫，太阳殿、吕祖亭、真人观等古建筑。北麓有一条随潮汐隐现的天然坝直达北岸。落潮时是车辆、游人登岛的天然通道。俗称“天桥”。大笔架山岛以“笔峰插海”誉为锦州八景之一，已辟为对外开放游览区。周围岩石滩上盛产牡蛎。西侧有建设中的锦州港。