（2）承担大足石刻和“大足学”的研究工作。参与科研项目的组织实施；参与学术交流活动；参与学术著作的编辑和出版；参与科研成果的宣传、推广。

（3）承担大足石刻的管理事务工作。承担大足石刻文物安全事务工作；承担大足石刻及其文物区内旅游参观秩序、游客和商业活动的统一组织管理的有关事务工作。

（4）承担大足石刻博物馆综合运营管理、接待服务、陈列展览、对外交流、藏品征集和保管、馆藏文物安全的有关事务工作。

（5）承担大足石刻利用事务工作。承办弘扬大足石刻文化、塑造大足石刻品牌、对外宣传推广大足石刻的相关事务工作；承担大足石刻产业发展的有关事务工作；承担大足石刻文化创意研究和产品开发的有关事务工作。

（6）承担市文化和旅游发展委员会(市文物局)及大足区委、区政府交办的其他任务。

大足石刻研究院(大足石刻博物馆)，为市文化和旅游发展委员会（市文物局）所属副厅级公益二类事业单位，委托大足区管理。核定大足石刻研究院(大足石刻博物馆)事业编制165名。设院长(馆长)1 名，党委书记 1 名，副院长(副馆长)5 名(其中1名由党委书记兼任)，纪委书记 1 名。内设机构处级领导职数38名。

核定事业编制165名，现有在编人员131人，拥有享受国务院政府特殊津贴专家2名、高级职称人员31名、中级职称人员40名，博士研究生6名、硕士研究生30名；现有博士后科研工作站1个（大足石刻研究院博士后科研工作站）、市级专家工作室2个（全国劳模黎方银创新工作室、陈卉丽石质文物保护修复首席技能专家工作室）、市级科研平台2个（重庆市人文社会科学重点研究基地、大足石刻研究院南方石质文物保护研究中心）。

大足石刻研究院(大足石刻博物馆)设18 个内设机构(正处级)：

（1）办公室。负责贯彻和督办党政办公会议的各项决议、决定；负责日常行政事务、文秘、督办、政务信息、档案、保密、目标管理等工作。

（2）组织人事处(纪检室)。负责党建、纪检、组织、统战、编制、人事等工作。联系工会、共青团、妇委会等群团工作。

（3）计划财务处。负责预决算、会计核算、财务管理、审计、政府采购和固定资产管理等工作。

（4）科研管理处。承担科研工作规划，科研课题和项目的组织管理，以及科研成果管理和科研合作等工作。

（5）安全保卫处。承担大足石刻文物和景区安全工作，以及信访、稳定等工作。

（6）规划建设处。参与大足石刻基础设施和公共服务设施建设项目方案的编制、实施、管理和维护的相关工作。

（7）保护技术研究中心。开展大足石刻保护科学技术研究，承担保护和修复技术的创新、引进和指导等工作。

（8）保护工程中心。承担大足石刻保护工程方案的编制和实施，以及大足石刻日常保养维护等工作。

（9）监测中心。开展大足石刻相关数据的监测、收集、整理和分析，承担文化遗产监测平台对接等工作。

（10）文物数字化研究中心。承担大足石刻数字化和智慧化项目的研究、实施等工作。

（11）大足学研究中心。承担“大足学”学科建设相关事务工作；承担大足石刻历史、艺术、文化、宗教方面研究和学术交流等工作。

（12）考古研究中心。承担大足石刻的勘探、发掘等考古研究方面的具体工作。（13）宣传推广中心。承担策划和组织实施大足石刻宣传活动，传播、推广大足石刻文化和项目。

（14）文化创意研究和产业发展中心。承担大足石刻文化创意研究，以及相关产业发展、文化产品开发等事务工作。

（15）陈列展览中心。承担藏品的征集、保管、陈列展示和对外展览等工作，以及大足石刻博物馆场馆的日常管理工作。

（16）数字展示和接待中心。承担大足石刻数字展示和参观接待等事务工作。

（17）宝顶山石刻管理中心。承担宝顶山石刻综合管理相关事务工作。

（18）北山石刻管理中心。承担北山、南山、石门山、石篆山石刻综合管理相关事务工作。

党委书记、副院（馆）长：熊子华

党委副书记、院（馆）长：蒋思维

党委委员、副院长(副馆长)：刘贤高

党委委员、副院长(副馆长)：黄秒斌

党委委员、副院长(副馆长)：龙伟

党委委员、纪委书记：胡蓉

党委委员、副院长(副馆长)：艾智科

2020年12月，被国家卫生健康委授予“2020年全国敬老文明号”。

2021年8月，被中国侨联确认为第九批中国华侨国际文化交流基地。

2022年6月29日，重庆市的大足石刻研究院表示，为期5年的重庆市石窟寺及石刻铭文抢救性搜集工作正式启动。