大通桥站为宁波轨道交通2号线与宁波轨道交通3号线的换乘站，车站位于规划中的青云路和锦堂路的丁字形路口，东侧紧邻大通河，主体呈东西向布置。宁波轨道交通2号线车站为地下二层岛式车站，宁波轨道交通3号线车站为地下三层岛式车站。地下一层为站厅层（换乘大厅），地下二层为2号线站台层及3号线设备层，地下三层为3号线站台层。

运营初期开放A、C、D、E、F五个出入口。A出入口位于规划锦党路东侧（大通河边），青云路和锦堂路的交叉路口；C口通往仓储路公交站；D出入口位于规划青云路与规划锦党路交叉路口（青云路北侧）；E出入口位于规划青云路与规划锦党路交叉路口（青云路南侧）；F出入口位于环城北路与大通北路交界处。

车站设自动售检票机12台，闸机27台，客服中心2个。