奉天宫内供奉有妈祖神像等，所奉妈祖神像缘于福建湄洲岛。

相传明朝天启二年(1662年)船户刘定国为确保航行安全，特意从湄洲祖庙迎一尊妈祖圣像置于船上奉祀，后将其供奉于台湾笨港，称为湄洲五妈或船仔妈。

康熙三十九年(1700年)当地信众便在笨港街合建天妃庙供奉这尊妈祖像，后称天后宫。

嘉庆四年(1799年)笨港妈祖庙不幸遭大水冲毁。

嘉庆十六年(1811年)，将所有文物(包括妈祖神像)移至笨港所辖新港内重建妈祖庙，并得嘉庆皇帝敕封为奉天宫。