1994年9月7日，执导的剧情片《不夜天皇后》在法国上映，该片入围第47届戛纳国际电影节主竞赛单元。1996年9月9日，执导的剧情片《深深的腥红》在加拿大上映，该片入围第53届威尼斯国际电影节主竞赛单元，并获得第13届圣丹斯国际电影节拉美电影奖-荣誉提及奖。

1998年4月29日，执导的剧情片《奇迹的福音》在墨西哥上映，该片由亚松森·巴拉格尔、布鲁诺·比希尔等人联袂出演。1999年，参演纪录片《黑泽：最后的皇帝》；6月2日，执导的剧情片《没人写信给上校》在法国上映，该片入围第52届戛纳国际电影节主竞赛单元，并获得第16届圣丹斯国际电影节拉美电影奖。

2000年2月25日，参演的纪录片《布努艾尔谈话录》在西班牙上映；9月14日，执导的剧情片《恨他入骨》在加拿大上映，该片由拉米雷斯·阿奇莉亚、帕特里夏·雷耶斯·斯平多拉等人联袂出演；9月27日，执导的犯罪片《男人的毁灭》在西班牙上映，该片获得第48届圣塞巴斯蒂安国际电影节主竞赛单元-金贝壳奖。

2002年8月30日，执导的剧情片《欲望处女》在意大利上映，该片获得第59届威尼斯国际电影节电影逆流单元-特别提奖。2006年，执导的剧情片《所多玛的狂欢节》在墨西哥上映，该片由玛丽亚·巴兰科、卡洛斯·科博斯等人联袂出演。2008年7月，获得第43届卡罗维发利国际电影节终身成就奖。2011年10月7日，执导的剧情片《心之理由》在西班牙上映，该片由维拉迪米尔·克鲁兹、拉米雷斯·阿奇莉亚等人联袂出演。

2012年10月，担任第17届釜山国际电影节“未来景象单元”评委并获得第17届釜山国际电影节终身成就奖。2015年9月15日，执导的剧情片《无望街头》在加拿大上映，该片参加第72届威尼斯国际电影节非竞赛单元展映。2016年11月16日，与佩内洛普·克鲁兹、圣地亚哥·瑟古拉等人联袂出演的剧情片《西班牙女王》在西班牙上映，该片由费尔南多·楚巴执导。

2019年9月12日，执导的剧情片《两腿之间的魔鬼》在加拿大上映，该片由西尔维娅·帕斯克尔、亚历山大·苏亚雷斯等人联袂出演。

奥图罗·利普斯坦被认为是唯一真正继承电影大师路易斯·布努埃尔风格的电影作者，他偏好的故事风格为死亡通俗剧，将通俗剧中的爱恨情节推展到某种毁灭性的极致；他始终在不遗余力的挖掘人性的黑暗，他的目光总是落在那些被摧残和扭曲的灵魂上；孤独、禁锢和疯狂的爱是利普斯坦每一部作品中的三大主题，他喜欢杀人的情人、嫉妒的妓女和宗教狂热分子，他的角色很悲惨；快乐和它的不可能总是利普斯坦坦感到沮丧，潜入他的宇宙是痛苦的但迷人的，这就像是一种放松的方式。（新浪网、1905电影网、Cafe Babel综合评）