保护单身妇女，遂将男女分开，建立该营。至江苏南京（改称天京）后，据《贼情汇纂》载：女军（实即天京女营）共四十军，以前后左右中和一至八数字编次，军帅四十人，卒长一千人，两司马（即管长、馆长或牌长）四千人，女兵十万人（后约十余万人）；每军设军帅一人，下统二十五卒长，每卒长领四两司马，共一百两司马，每两司马管二十五人，共二千五百人；不设师帅、旅帅，与男营营制稍异。其中广西妇女起骨干作用，肩负作战任务；其他地方妇女一般不参战，多从事肩米、背盐、负煤、斫柴、荷砖、抬瓦、筑营、运土、挑水、开沟、浚濠、劈送竹签、割麦、割稻、搓麻绳等劳作。1855年1月（咸丰四年十二月，天历甲寅四年十二月）太平天国恢复家庭制度后撤销。但分别男行女行的制度并未因此废除，后在一些新占领区，初时仍设女馆，待秩序大定再行解散。