姑子庵有一个院落组成，北阁3间2层为文昌阁，内塑奎星先师。南阁三间2层为白衣阁，内塑观音老母和白衣大士。东面是4间平房，南边两间是送生娘娘殿，上悬一木匾，写有“众生之母”四个大字。北面两间是十大夫殿，殿内塑华佗、孙林、张子和、张介宾、刘河涧、扁鹊、张仲景、张思邈、徐文伯和皇甫士安的像，是人们求医看病的地方。西面3间是官厅，门上方悬一木匾，是清初颜神翰林赵执信亲笔书写的“法云慧日”四个大字。官厅北面是山门。