明崇祯十三年（1640年）进士。初授浙江兰溪知县，调东阳。未几，有许都之乱，东阳城陷。孙棐一面派人请求援军，一面联络义勇，克复东阳。因功升兵部职方司主事。姚孙棐因忤逆奸臣阮大铖，结果被捕入狱，正遇清军大部南下，因此得与解脱。 后归隐龙眠山。自传称“樗七岁知文，十岁曰诗，三十余后成士，五年而废。性好名山水，所涉历辄徘徊不能去。性急，少容忍，有逆于心，必冲于口。过辄忘之，胸无宿怨，以是容于人焉。”其风骨可见，诗隽永。

姚孙棐有《亦园全集》六卷传世，存诗千余首。