旧馆坐落在婺源县城紫阳镇西侧的儒学山上，为一幢具有民族特色的仿古式三层建筑。三楼一顶层的殿宇式结构，白墙仿古殿黄瓦，檐角飘翘，展厅面积1000多平方米。馆内展出内容原分为“精品陈列室”、“婺源古建筑展览”、“砚史陈列”等部分。2007年5月由儒学山原馆迁至现址，位于婺源县城紫阳镇文公北路，主体为具有浓郁地方特色的现代徽派建筑，馆区面积5万余平方米，展厅面积6000余平方米。陈列厅现设有婺源千年、茶乡美器、工艺珍宝、砚国明珠、明清书画和当代艺术等六个专题展厅，集中反映原隶属古徽州婺源的历史风貌及人文典故。博物馆第年接待游客数万人次，随着婺源文化与生态旅游的不断升温，近年接待游客数量不断增多。

馆内精品有东汉元兴元年陶权、两宋名瓷名砚、明代鎏金錾花铜烛台、钿翠座屏、透雕蟒纹玉带等、明代刘世儒《墨梅图》、吕纪《芦雁图》、清代渐江《黄山图》，以及明代祝枝山、文徵明、董其昌、冯梦龙，清代郑板桥等名家书画代表作。此外，汉代番汉兴铜洗、明代翡翠鳌鱼佩、明代松纹犀角杯、清代猫眼等数百件文物也极为珍贵。其中，钿翠座屏是由名贵鸟羽组成的大型牙雕插屏；明代鎏金錾花铜烛台（也称百花金莲炬）是一座铜制烛台，重90公斤，高2米，图饰由一百支牡丹、芙蓉、金菊花组成；朱熹使用过的宋代陶砚，为海内仅见；大型翡翠画，重300克，也为稀世珍宝。