1988年，参加中国自然科学基础性研究现状与对策调研工作。

1991年，参加国家自然科学基金委员会编写《中国生态学发展战略研究》等工作。

1993年，当选为中国科学院院士。

2002年，把工作重心迁至华南师范大学，与两个学生一起进行海洋水产研究，每年夏天回到北师大工作。

2007年，捐出自己50多万元的积蓄设立了一个助学基金，资助对生态学有重要贡献的年轻师生。

2020年2月14日，因病在广州逝世，享年93岁。

孙儒泳以8个季节的实验资料，证明地理上相距仅110公里的两个种群间存在着静止代谢率的地理变异，它平行地出现于两种小啮齿类，生活在草甸中的普通田鼠（Microtusarvalis）和森林中的欧鼦（Clethrionomysglareolus），从而为兽类提供了地理物种形成假说的生理生态学证据，同时，提出了地理变异季节相的新概念；研究长爪沙鼠（Merionesunguiculatus）代谢率随环境温度变化，发现静止代谢率与平均每日代谢率的变化率不同，提出以20℃下ADMR为主要参数的Weiner日能量收支（DEB）模型应予以修正；提出恒温动物的恒温能力的一个新指数，在应用上优于Ricklef指数；发现晚成性根田鼠的体温调节能力的胎后发育呈“S”型，可划分为三个时期。

根据2020年3月北京师范大学网站显示，孙儒泳撰写和参与撰写的专著、译著、高校教材等共16种，在中国国内外学术刊物上发表论文110余篇。

孙儒泳参加社会学术活动，组织生态学电视广播，主办生态学先进理论和方法学习班，为党政干部、鼠防占线干部编写了不同类型的生态学教材和自然科学普及读物等。

截至2020年2月，孙儒泳先后获得1983年北京市科技二等奖、1991年农业部科技进步二等奖 、1994年中国科学院科技进步二等奖、1996年国家教委科技进步三等奖、1999年国家自然科学三等奖等。

孙儒泳重视培养学生的动手能力，他对学生严格要求，并充分培养他们独立思考和独立工作的能力。他认真地指导研究生论文的选题、实验设计和总结写作。在确定论文题目时，他注意到发挥每个研究生的特长、充分调动他们的积极性，并经反复讨论才确定。对在实验中和总结写作中出现的问题，他都详细地批改，并和学生进行细致充分的讨论，使学生学到了分析问题和解决问题的能力。

孙儒泳先后为本科生讲授《动物生态学》《脊椎动物学》《生物统计学》等课程；为硕士研究生开设《动物生理生态学》《高级生态学及兽类学》课程。他重视对学生的知识传授，每次上课他总认真备课，反复推敲。

孙儒泳关心中国国内外生态学科的发展，不断搜集新资料补充丰富教材。他编著的90万字的《动物生态学原理》一书获得第二届高校教材评审全国优秀奖和1992年全国教学图书展一等奖。

截至2012年9月，孙儒泳先后培养硕士生12名、博士生21名，博士后4名，进修教师、访问学者各一名，有的已升为研究员和副所长，有的硕士生毕业后赴美、英攻读博士学位。

孙儒泳先后担任中国生态学会第一、二届常务理事，中国生态学会第三届理事长，国务院学位委员会第二届学科评议组成员，国务院学位委员会和国家自然科学基金会生态学科评审组成员，教育部高等学校理科生物学教学指导委员会成员，北京市政府水产科技顾问团成员，《生态学报》和《兽类学报》副主编，《动物学报》和《动物学研究》编委，美国《生理动物学》（Physiological Zoology）编委；兰州大学干旱农业生态国家重点实验室学术委员会主任委员，中国科学院动物研究所虫鼠害生物学国家重点实验室学术委员会主任委员，全国师范院校科技教育顾问。

孙（儒泳）先生的年岁不断增长，但学习和探索的热情从未消退，始终走在学科发展的最前面，为中国的生态学研究开辟着道路。（孙儒泳的学生、北京师范大学教授牛翠娟评）

孙（儒泳）先生不仅在把生态学引入中国、引入课堂的过程中，做出了开创性的贡献；他对生态学走向中国社会，深入国民人心，也发挥了不可替代的作用。（孙儒泳的学生、重庆师范大学教授曹振东评）

孙儒泳院士是中国种群生态学和生理生态学研究的主要开拓者，他在近60年的教书育人生涯中，成果丰硕，为国家培养了一批高质量的生态学教学、科研和管理人才，他一生严谨治学，淡泊名利，提携后学，为中国生态学科教事业做出了杰出贡献。（华南师范大学评）