守望者正在看守军火库时，孙小猴来找他玩。随后花田出现，袭击了守望者，孙小猴用棍子捅花田的菊花，结果被花田打飞，导致重伤。迷路的白小飞看到小猴飞了过来，就背上小猴走向小猴飞来的方向，进入军火库，找到了一管KW89，便给小猴喝了半管，自己也喝了半管。随后花田出现，孙小猴目睹了白小飞打跑花田的过程，便决定拜白小飞为师替父报仇。

孙小猴随着白小飞来到基地一层大厅后，龙右出现，释放次声波放倒了包括小猴在内的许多人。没一会儿许多猪尸兄闯入撤离点，小猴由于得到了强化，醒的比较早，结果正好后面有个猪尸兄要攻击孙小猴。小胖及时过来砍断了猪尸兄的手臂，救下了孙小猴。龙右离开后，孙小猴跟随白小飞等人去寻找小薇。

在接近小薇家的地方一行遭遇尸兄，小鹿受到惊吓滚入尸兄堆里。小飞去救小鹿并吸引了尸兄们的注意力，小胖趁机带其他人先行来到小薇家。第二天清晨，小胖出去打探消息，小猴在小薇家里立了四个酒瓶在上面练俯卧撑。在开胃奶长出“黑蛇”后，一行人前往中医院。

一行人在中医院里遭到暗日魔术师等人的攻击，处于劣势。孙小猴用“偷菊棍法”偷袭暗日魔术师，反被暗日魔术师用飞布变成眯眯眼，什么也看不见了。暗日魔术师要用拐杖剑戳死孙小猴，被开胃奶用“偷蛋脚”再次攻击，坚持不住了，用魔布来到楼上用麻醉剂麻晕了一伙人。

暗日魔术师被击败后，一行人在医院3号楼二楼找到了张地图，商量了接下来的计划。大家睡着后，白小飞由于意外被蛇吞了离开了医院楼，一些婴儿尸兄趁机进入房间从通风口带走了小鹿。小胖被小鹿的呼救声惊醒，急忙叫醒了大家，并让身材小的小猴跟过去打探情况。

孙小猴跟着婴儿尸兄一路来到婴儿房，发现了小鹿，便急忙脱下一只臭鞋扔过去，熏走了靠近小鹿的婴儿尸兄，却又来了一个很大的婴儿尸兄。孙小猴急中生智，拉了一坨“翔”在上衣上，然后迅速将上衣包起扔向巨大婴儿尸兄，成功将其熏跑。然后孙小猴带小鹿离开婴儿房，找到了大家，但五人最终被众蛇围困在楼顶，无处可逃。

随后军队赶到，来到楼顶，却怀疑小胖等人是欧盟间谍，让他们别乱动。一会儿楼顶上出现了许多透明的蚯蚓，袭击了军人，楼顶军人全军覆没。小胖等人赶紧沿绳索下楼。结果刚下楼，就遭到杰克的攻击。余晓佳便让开胃奶背上小胖带着小猴、小鹿先行离开，自己留下来对付杰克。

开胃奶带大家离开医院，却发现黑色火线的人带走了小薇，来到黑色火线救小薇，几人却被抓了。后来白小飞来了，将大家救走，一路回到坟地烧烤，找到了炎黄蜻蜓战机，并把孙小猴送上了炎黄蜻蜓战机。在飞机上，胡爱才为了减轻负重把小鹿故意绊下了飞机，孙小猴大怒，也立即将胡爱才踹下了飞机。然后孙小猴在飞机上看着接受治疗的小胖和余晓佳，并安全离开了H市。

到了京城后，胡爱伦仗着他当官的外公，把小猴等人赶出了安全城，多亏鱼博士送了小猴等人很多装备。

小猴等人准备从京城五环南面离开京城，却遇到小学神带领的大量尸兄。小胖和晓佳打了一些尸兄，小胖又让小猴用Y激光面具攻击旁边的楼。小猴用激光切断了楼，暂时挡住了尸潮。随后几人继续边打尸兄边往城外逃。小胖拖延着尸舌让其他人快走，但是到处都是尸兄根本没地方好去。小猴被一只镰刀盔尸兄追杀着，这时四队的水银人赶来攻击镰刀盔尸兄救下了孙小猴，并让小猴他们快到自己身后的装甲车里，随后小林和找乐子也先后赶来，与小学神等人交战。

小猴等人躲在一旁观战，被开胃奶、小瞳和“白小飞”找到。“白小飞”过去帮忙对付小学神，但小学神召唤了尸·拉达赶跑了小猴等人。小猴等人往前跑着，又遇到了真正的白小飞等人。白小飞消灭了拉达后，小胖便带着白小飞去见了另一个“白小飞”，并一起目睹了“白小飞”击败进化之眼。随后两个白小飞便进小树林聊了聊。两个白小飞出来后，将藏区来的“白小飞”称呼为“黑小飞”，并从陌轩出得知圣去了皇宫，便让其他人去了安全屋。