1941年，孙与战友在一座山上被日伪包围袭击，在敌众我寡、无法脱险的情况下，他与战友一起跳下悬崖，战友们壮烈地牺牲了，他却奇迹般地幸免于死。伤愈后，组织调其从事党的机要工作，直到全国解放。

建国后，先后任鲁南军区司令部机要科股长、中共徐州市委机要科科长、政务院机要处科长、中南局计划二机局三处处长、广东电子工业办公室副主任、湖北省电子科研所所长兼党支部书记等职。1951年他任政务院机要处科长时,曾随刘少奇 赴苏联、朝鲜访问。