1254年，大蒙古国灭大理国后，忙于攻打南宋，无暇顾及大理国偏远地区；今孟连的傣族首领据地自治。

1289年，元朝（前大蒙古国）在大理金齿等处宣抚司孟定路东南增设木连路；今孟连属木连路。1329年，元朝分大理金齿等处宣慰司都元帅府（原大理金齿等处宣抚司）所辖的木连路、银沙罗甸设银沙罗甸等处宣慰司都元帅府；今孟连属银沙罗甸宣慰司都元帅府。1348年，勐卯（瑞丽江河谷盆地）崛起的勐卯龙（汉译“麓川国”）吞并银沙罗甸宣慰司；今孟连傣族拉祜族佧佤族自治县境属勐卯龙。1355年，勐卯龙归附元朝、其控制区域置平缅宣慰司；今孟连傣族拉祜族佧佤族自治县境属平缅宣慰司。

1384年，勐卯龙（元朝平缅宣慰司）归附明朝，其控制区域置麓川平缅宣慰司；今孟连傣族拉祜族佧佤族自治县境麓川平缅宣慰司。1406年，明朝分麓川平缅宣慰司地设孟琏长官司（辖今萨尔温江以东的掸邦地及澜沧江以西的澜沧、孟连、西盟等地）；今孟连傣族拉祜族佧佤族自治县境属孟琏长官司。1428年，麓川平缅宣慰司脱离明朝、恢复勐卯龙；公元1439年，勐卯弄东征兼并孟琏长官司；今孟连傣族拉祜族佧佤族自治县境又属勐卯龙”。1441年、1442年、1448年，明朝倾半国之力“三征麓川”，勐卯龙政权被逼到伊洛瓦底江以西地区（今缅甸克钦邦），孟琏长官司复置；今孟连傣族拉祜族佧佤族自治县境属孟琏长官司。1521年以后，孟琏长官司废置，“孟琏与孟养、孟密诸部仇杀数十年，司废”；1585年，孟琏土官归附明朝、复设孟琏长官司；1606年，孟琏土官归附东吁王朝；今孟连傣族拉祜族佧佤族自治县境随孟琏土官一起夹在明朝与东吁王朝之间。

1662年，孟琏土官归附清朝、其控制区域置孟连长官司；今孟连傣族拉祜族佧佤族自治县境属孟连长官司。1709年，孟连长官司升级为孟连宣抚司；今孟连傣族拉祜族佧佤族自治县境属孟连宣抚司。

公元1764年，孟连宣抚司由永昌府划予顺宁府；今孟连傣族拉祜族佧佤族自治县境属孟连宣抚司。

1799年以后，孟连宣抚司北境、勐勐巡检司南境的倮黑人脱离傣族土司掌控，武装夺取傣族土司的领地；1888年，清朝出兵平定倮黑人后，将孟连宣抚司北境八土目辖地和勐勐巡检司析出设直隶镇边抚夷厅、由内地派出直隶同知管辖；1891年，耿马宣抚司所属的勐董、勐角土目与耿马土司发生仇杀事件后，勐董、勐角由耿马宣抚司划归直隶镇边抚夷厅；1892年，倮黑五佛主暴动，清朝镇压过程中招降“三佛主”李通明，承认他为西盟土目，划归直隶镇边抚夷厅；1894年，孟连宣抚司由顺宁府划归直隶镇边抚夷厅，所属上允土把总、下允土千总析出由直隶镇边抚夷厅直辖；今孟连傣族拉祜族佧佤族自治县境属直隶镇边抚夷厅。

1913年，民国政府裁直隶镇边抚夷厅，改设镇边县；1915年，镇边县改为澜沧县；1929年，澜沧县将辖地土目、土司辖地归并为10个区，选择区内势力较大的土目、土司担任区长；1932年，按山川行便调整为8个区，打乱土目、土司的管辖范围；1940年，澜沧县废区、改划为13乡2镇，式微的土目、土司被纳入乡镇保甲制以内；今孟连傣族拉祜族佧佤族自治县境属澜沧县。

1949年2月，中国共产党迤南边区人民自卫军第一支队占领澜沧县，成立澜沧专员公署，下设澜沧县、上允县、东朗县、孟连傣族拉祜族佧佤族自治县、溯涛（宁江）县等临时人民政府；公元1949年12月，澜沧区专员公署撤销，澜沧县、上允县、东朗县、孟连傣族拉祜族佧佤族自治县合并为澜沧县；今孟连傣族拉祜族佧佤族自治县境先属澜沧专员公署、后属澜沧县。

1954年6月，澜沧县所辖孟连区、南卡区合设准县级孟连傣族拉祜族卡佤族自治区。

1959年12月，准县级孟连傣族拉祜族卡佤族自治区改为孟连傣族拉祜族卡佤族自治县。

1963年9月，孟连傣族拉祜族佧佤族自治县改为孟连傣族拉祜族佤族自治县。

2021年12月21日，被云南省人民政府公布为陆地边境口岸城市。

截至2023年末，孟连傣族拉祜族佧佤族自治县辖2个乡（公信乡、景信乡），4个镇（芒信镇、勐马镇、娜允镇、富岩镇）。

孟连傣族拉祜族佧佤族自治县位于云南省西南部，地处东经99°9‘-99°46’、北纬22°35‘-22°32’之间。东与澜沧拉祜族自治县、北与西盟县相连，西部、南部与缅甸掸邦第二特区相连，国境线长133.399千米，总面积为1893.42平方千米。孟连傣族拉祜族佧佤族自治县县城距省会昆明645千米，距市政府驻地思茅区230千米。

孟连傣族拉祜族佧佤族自治县地质主要为二叠纪玄武岩、三叠纪多种岩类组成，由第四纪河流冲积构成。二叠纪形成的玄武岩，分布在芒信镇的班顺、岔河、芒信一带。从景信乡的勐英起至孟连坝止的南垒河上游河谷地带，由石灰石组成。勐马镇的贺俄以南、哈布壳山以北，以及南主、南抗、南弥一线，分布着粗粒结晶类的花岗岩。朗勒、孟连、勐马、勐阿等坝子，是第四纪河流冲积静水沉积盆地区，其中以孟连坝最典型。

孟连傣族拉祜族佧佤族自治县地处怒山余脉，地貌以山地为主。南北部多高山峻岭；东西部偏低，多河谷盆地。北部的大黑山，海拔2239米；南部的哈布壳山，海拔2196米；东部的孟连坝，海拔960米；西部的勐马坝，海拔920米。境内最高点是位于南部的昂朗山峰顶，海拔2603米；最低点是位于西部的南永河与南卡江交汇处，海拔497米。地形属以山区为主谷坝相间的复合类型。在群山中有一些宽谷盆地，较大的有孟连、勐马、勐阿等坝子，其次是朗勒、景信、景冒、勐白、芒信、芒街等坝子。

孟连傣族拉祜族佧佤族自治县属南亚热带气候类型，境内气候垂直变化明显。冬无严寒，夏无酷暑，四季如春。年平均气温为19.6℃，最高气温达36℃，每年1-2月最冷，平均气温13℃左右。年平均降雨量1373毫米，5-10月为雨季，雨量占年降雨量的87.7%，年雨日达170天左右。年平均日照2048.6小时。风速一般为3级，最高达6至7级。

孟连傣族拉祜族佧佤族自治县河流分属澜沧江、怒江两大水系，大黑山-哈布壳山为分水岭，把境内河流分成以南垒河、南卡江为干流的东西两个水域。

南垒河发源于澜沧县拉巴乡，在缅甸东部边境汇入澜沧江下游的湄公河，在孟连傣族拉祜族佧佤族自治县境内长70千米。主要支流有南朗河、南各河、南白河、南雅河、南碾河、南咤河、南基河、允元河等，流域面积1293平方千米。

南卡江位于西部边境，是中缅界河。入境后从北向南经富岩、公信、勐马3个乡镇，在仑吾山脚流至缅甸，境内长58千米。主要支流有格浪爱河、格浪歪河、南信河、南梅河、南马河、南永河等。

孟连傣族拉祜族佧佤族自治县境内水资源主要为地表径流水和地下径流水两部分。年平均降水量1373毫米，全年产水量16.29亿立方米，入境水量10.61亿立方米，出境水量26.54亿立方米，每平方千米产水量为86.03万立方米。水能资源储量为56万千瓦。

孟连傣族拉祜族佧佤族自治县植物主要有龙血树、椿、樟、松、杉、芒果、菠萝、龙竹等。动物主要有虎、豹、熊、猴、山驴、穿山甲、蟒等。

孟连傣族拉祜族佧佤族自治县已发现煤、铁、锑、铅锌、金、石灰石等17种矿产资源。铁矿主要有允沟铁矿、完弄铁矿和板宋铁矿；铅锌矿主要有景冒铅锌矿、公鸡铅锌矿和南喀铅锌矿；金矿分布于英山和芒信两地，为小型矿床；褐煤分布于景信和景冒第四系盆地中。其中，煤矿储量360.14万吨、铅锌矿22.4吨、金矿721千克。

截至2023年末，孟连傣族拉祜族佤族自治县人口出生率为8.52‰，死亡率为7.10‰，自然增长率为1.42‰。年末常住总人口13.97万人，其中：男7.25万人，女6.72万人；城镇人口6.30万人，乡村人口7.67万人，城镇化率45.10%。按年龄段分：0-15岁的有2.63万人，16-59岁的有8.69万人，60岁及以上的有2.65万人，65岁及以上的有1.17万人。公安部门提供的年末全县总户数39432户，户籍人口134331人，比上年增加666人，其中：男67639人，女66692人；农村人数105253人，城镇人数29078人。少数民族人数116315人，占总人口的86.53%，其中：傣族27210人，佤族32738人，拉祜族41426人，分别占总人口的20.24%，24.36%，30.82%。

孟连傣族拉祜族佧佤族自治县境内有傣族、拉祜族、佤族等21种少数民族，少数民族人口占总人口的86%。

2023年，孟连傣族拉祜族佤族自治县地区生产总值603066万元，按照不变价格计算，同比增长5.0%，增速高于全省和全市0.6和1.4个百分点，低于全国0.2各位百分点。分产业看，第一产业增加值188404万元，增长4.4%；第二产业增加值86145万元，增长2.2%，在第二产业中，工业增加值44024万元，下降3.5%；建筑业增加值42333万元，增长8.1%；第三产业增加值328517万元，增长6.1%。按常住人口计算，人均生产总值42816元，可比增长5.7%。

2023年，孟连傣族拉祜族佤族自治县完成一般公共预算收入24021万元，比上年增收293万元，增长1.2%，其中：税收收入12362万元，比上年增收119万元，增长1.0%；非税收入11659万元，比上年增收174万元，增长1.5%。在税收收入中增值税6127万元，下降18.9%；企业所得税479万元，下降19.8%；个人所得税604万元，增长2.9%。一般公共预算支出187707万元，比上年减支9929万元，下降5%，其中：一般公共服务支出22767万元，增长16%；公共安全支出14245万元，增长6.3%；教育支出25153万元，下降6.9%；科学技术支出439万元，下降80.4%；社会保障和就业支出18113万元，下降3.4%；卫生健康支出35428万元，增长9.8%；节能环保支出6310万元，下降30.1%；城乡社区支出8054万元，下降23.2%；农林水支出32780万元，下降21.5%；交通运输支出9637万元，增长29%；住房保障支出4536万元，下降38.3%。

2023年，孟连傣族拉祜族佤族自治县固定资产投资施工项目128个，新开工项目76个。完成固定资产投资（不含农户）同比下降16.2%。按国民经济行业分：第一产业同比增长62.7%；第二产业同比下降27.6%；第三产业同比下降24.2%。按重点行业分：房地产业同比下降80.0%；电力工业同比增长5.7%；非电工业同比下降36.4%；交通运输仓储及邮政业同比下降14.4%，其中：公路运输业同比下降28.8%；水利、环境和公共设施管理业同比下降18.2%；教育同比增下降49.0%。

2023年，孟连傣族拉祜族佤族自治县实现农林牧渔业总产值314696万元，按可比价计算，比上年增长4.5%。其中：农业产值227045万元，增长4.9%；林业产值43007万元，增长4.0%；牧业产值28374万元，增长4.0%；渔业产值5512万元，下降3.3%；农林牧渔服务业产值11121万元，增长4.5%。

2023年，孟连傣族拉祜族佤族自治县粮食种植面积29.775万亩，比上年增加0.714万亩。粮食总产量7942万公斤，比上年增产192.5万公斤，增长2.5%。按常住人口计算，人均占有粮食568.5公斤。粮经比例为60.62：39.38。四大粮食作物产量“三增一减”：稻谷产量3550.9万公斤，比上年下降14.79%；玉米4155.3万公斤，比上年增长23.16%；豆类120.7万公斤，比上年增长28.13%；薯类产量35.1万公斤，比上年增长17.39%。

2023年，孟连傣族拉祜族佤族自治县甘蔗面积77983亩，比上年增加400亩，增长0.5%，产量424443.4吨，比上年增加20211.08吨，增长5%。橡胶面积301000亩，比上年减少2313亩，减0.76%，其中:开割面积282101亩，比上年增加10850亩，增长4%；干胶产量27646吨，比上年增加1017.9吨，增长3.8%。茶叶面积103610亩，比上年持平，其中：采摘面积97403亩，比上年持平；干茶产量6240吨，比上年增加278吨，增长4.7%。咖啡面积110618.9亩，比上年持平，其中：采摘面积106899.6亩，比上年增加7716.55亩，增长7.8%；产量10100吨，比上年增加1000吨，增长11%。

2023年，孟连傣族拉祜族佤族自治县肉类总产量7964吨，增长4.8%。按常住人口测算，人均肉产量56公斤。水产品产量4015吨，与上年持平。

2023年，孟连傣族拉祜族佤族自治县完成工业增加值44024万元，按可比价格计算，同比下降3.5%。完成规模以上工业总产值144875万元，比上年增长8.1%。按行业分:采矿业完成产值5810万元，比上年下降34.90%；制造业完成产值139065万元，比上年增长11.35%。完成规上工业增加值同比下降3.0%。规模以上工业企业实现营业收入110186万元，比上年增长5.3%，实现利税11809元，比去年增长643.4%；利润9059万元，比去年增长315.8%；产品销售率74.4%，比上年降低8个百分点，产成品库存34475万元，比去年增长123.8%。

2023年，孟连傣族拉祜族佤族自治县实现建筑业增加值42333万元，增长8.1%。拥有资质等级的建筑企业11个，期末从业人员1396人，完成建筑业总产值113064.5万元，比上年增长50.58%。

2023年，孟连傣族拉祜族佤族自治县完成社会消费品零售总额228280.65万元，比上年增长9.9%。其中：按消费形态分，商品零售业（批发和零售业）实现197112.1万元，增长9.0%；餐饮收入（住宿和餐饮业）实现31168.6万元，增长15.5%；按销售单位所在地分，城镇消费品零售额193319.8万元，增长9.7%；乡村消费品零售额34960.9万元，增长10.9%。限额以上批发和零售业零售额中，粮油食品类比上年增长19.8%；饮料类比上年增长40.8%；烟酒类比上年下降49.0%；服装鞋帽针纺织品类比上年增长1.6%；化妆品类比上年增长38.0%；日用品类比上年增长0.1%；体育、娱乐用品类比上年增长33.2%；书报杂志类比上年下降1.0%；电子出版物及音像制品类比上年下降36.6%；家用电器和音像器材类比上年下降44.4%；文化办公用品类比上年增长9.0%；家具类比上年下降73.8%；汽车类比上年增长30.9%。

截至2023年末，孟连傣族拉祜族佤族自治县金融机构人民币存款余额908158万元，比年初增加62923万元，同比增长7.44%。其中：住户存款769353万元，比年初增加77509万元，同比增长11.2%；非金融企业存款81864万元，比年初减少13536万元，同比下降14.2%；机关团体存款39083万元，比年初减少4979万元，同比下降11.3%；财政性存款8136万元，比年初增加4856万元，同比增长148.1%。金融机构贷款余额503510万元，比年初增加18865万元，同比增长3.89%，其中：住户贷款254480万元（短期贷款132202万元，中长期贷款122278万元），比年初增加11611万元，同比增长4.78%；企（事）业单位贷款249030万元，比年初增加7254万元，同比增长3%。

2023年，孟连傣族拉祜族佤族自治县有学校52所（含民办幼儿园12所）。其中：普通高中1所，普通初中5所，职业高级中学1所，小学26所，幼儿园19所。现有固定教职工1696人（含民办391人），其中：专任教师1474人（含民办210人）。初中专任教师学历合格率为100%，高中专任教师学历合格率为98.69%。校舍总面积达27.13万平方米。有班级614个，学校在校生26984人，其中：职业高级中学在校生171人，高中在校生1966人，普通初中在校生5849人，小学在校生13161人，在园幼儿5837人。小学适龄儿童入学率为100%，巩固率为99.23%，初中阶段毛入学率达103.03%，巩固率达98%，九年义务教育巩固率84.23%，高中阶段毛入学率达86.81%。

截至2023年末，孟连傣族拉祜族佤族自治县有广播电视无线发射台3个，广播电视文化服务中心6个；无线广播信号覆盖率99%，无线电视信号覆盖率99%。有文化馆1个，文化站7个，专业文艺表演艺术团1个，公共图书馆1个，图书馆藏书58525册（其中：少儿图书6063册、地方文献1800册），过刊合订本：8390册，已录入图书上架38625册，流动服务点6个。共有网吧6家，文化娱乐场所15家，图书经营店家2家，印刷公司（厂）2家，电影院3家，旅行社2家，打字复印社7家。全年，博物馆共接待游客人46692人次；统计有文物的国有单位2个；土司服饰、各民族文物及文献资料等文物约2092件。

截至2023年末，孟连傣族拉祜族佤族自治县共有各级各类医疗卫生机构81个，其中：国家医疗卫生单位11个，民营医院2个，个体医疗机构17个，村卫生室51个。编内外编制数共1086个，其中：编内编制494个，编外编制592个；有编内编外职工共1035人，其中：编内在职462人，编外在职573人；村医按每千人口一名应配备141人，现在职141人。全县共有执业（助理）医师377人，其中：村医中有执业（助理）医师11人，每千人口执业（助理）医师2.6人；注册护士547人，每千人口注册护士3.78人。核定编制床位数1198张，开放床位863张，每千人口床位数8.28张。

2023年，孟连傣族拉祜族佤族自治县基本医疗保险参保人数130907人，其中：城镇职工参保12262人，城乡居民参保118645人；截至2023年底累计有38.82万人次享受到城乡居民基本医疗保险报销；基金统筹支付8782万元，有7.6万人次享受到城镇职工医疗保险报销，基金统筹支付3080万元。基本养老保险参保人数91914人，其中：城乡居民养老保险参保75122人，城镇职工基本养老保险参保16792人（其中在职12923人，离退休3869人）。失业保险参保人数7453人。工伤保险参保人数12530人。

2023年，孟连傣族拉祜族佤族自治县享受城市最低生活保障居民人数为2780人次，全年累计支出保障金175.66万元；2023年享受农村最低生活保障居民人数为64121人次，全年累计支出保障金2119.62万元。发放沿边居民定居补助资金3691户10882人930.75万元。

孟连傣族拉祜族佧佤族自治县有公路2554.9千米，其中省道175.6千米，县乡公路354千米，乡村公路265千米，村组公路641.6千米，各类经济公路1117.8千米。按技术等级分，二级路8.798千米，三级路96.943千米，四级路350.446千米，等外路2098.713千米。

2023年，孟连傣族拉祜族佧佤族自治县拥有营运车辆964辆，其中货车732辆、客运车辆69辆、旅游车1辆、公交车6辆、出租车80辆、教练车72辆、租赁车4辆。全年客运量22.9522万人，旅客周转量2809.71万人千米。

孟连傣族拉祜族佧佤族自治县有渡口7个，营运船舶共计7艘。

中国孟连神鱼节

每年4月10-13日，“神鱼节”是一个原生态的民族文化旅游项目，有排他性、参与性和狂欢性，为地方特色节庆活动。为了感谢“神鱼”给人类带来的恩惠，每年傣历新年来临，人们都要颂经祭祀“神鱼”，并采取宗教仪式进行鱼类放生等活动。

孟连宣抚礼仪乐舞

娜允古城内有着与通常的傣族音乐截然不同的传统民间音乐，当地人习惯称它为“孟连宣抚礼仪乐舞”，在孟连傣族拉祜族佧佤族自治县勐阿村的芒朗寨、芒岗寨、芒允寨一带流传。

孟连金塔

孟连金塔位于南垒河畔，建成于1997年，由8个小塔环抱一个主塔构成，主塔高31.68米。

孟连宣抚司署

孟连宣抚司署是刀氏土司的府第，是娜允傣族历史文化名城的核心部分，由门堂、议事厅、正厅、东西厢房、粮仓、厨房及监狱、奴仆住房组成。为全国重点文物保护单位，也是云南省边疆民族地区18个土司衙门中保存最完整的一座。

勐马瀑布

勐马瀑布位于勐马镇东南面约3千米处，在高约35米、宽约5米的湖床陡壁上。瀑底有深约5-6米，面积约30米的半圆形深潭。

2021年12月，被云南省教育厅拟评为“云南省教育工作合格县”。

2022年3月，入选云南省“县域跨越发展先进县”名单。