2004年，国家教育部授予国家级重点中等职业学校。

2007年3月，经国家教育部和安徽省人民政府批准，由安庆卫生学校独立升格为安庆医药高等专科学校。

2011年，学校响应党中央支援西部大开发与民族团结的号召，承办内地新疆中职班。

2015年，作为北京大学继续教育学院安庆学习中心，承办药学、护理学本科专业。

2020年，成为安徽省内专科学校中首批“专升本”培养单位，与安徽医科大学联合举办4个本科专业。

2022年2月，获批安徽省地方技能型高水平大学建设单位。8月，安庆秉风康复医院成为学校附属医院。

2023年1月，安庆市第二人民医院成为学校附属医院。

2023年3月25日，安庆医药高等专科学校临床试验科技学院（双生谷临床试验科技学院）成立。

截至2024年1月，学校设有8个二级学院，开设31个普通专科专业。

截至2024年1月，学校有专任教师619人，其中，高级职称221人、硕士以上学历220人。拥有省级教学团队18个，省级教学名师12人，省级优秀教师4人，省级教坛新秀22人，省级专业带头人3人，省高校拔尖人才项目38项。

截至2024年1月，学校中央财政支持建设专业3个，国家骨干专业1个、省级示范特色专业6个、省级高水平专业群3个；立项省级精品课程、教学示范课程、金课60余项，校外实习基地336所。

截至2023年5月，学校获全国职院技能大赛高职组“化学实验技术”赛项三等奖一项，省级教学成果奖14项（其中特等奖1项），省级辅导员大赛特等奖1项，全国高校辅导员素质能力提升骨干训练营“优秀风采奖”1项。

截至2023年5月，学校设有直属附院1所，非直属附院、教学医院共21所，以及近200家校外实习实训基地。

截至2023年5月，学校省级以上教研、科研项目260余项。

2019年，学校校长李卫平获批主持国家自然科学基金项目一项，立项建设省级科学研究项目12项；教师发表论文100余篇（其中，一类SCI论文4篇），申请专利7项（其中，发明专利2项）。

2018年，学校获批立项省级自科、人文重点项目12项。教师发表论文100余篇，申请专利4件。

2016年，学校获批省厅自然科学重大项目1项，重点项目6项；人文社科重点项目5项；省级质量工程项目15项；发表论文52篇，实用新型专利40余件，申报待评高校自然科学研究项目7项、人文社科研究项目5项等。

《安庆医药高等专科学校学报》是由安庆医药高等专科学校主办的学术性期刊，为内刊。

截止到2023年6月30日，馆藏图书总册数97.17万册，其中纸质图书58.3万册（其中过刊装订本3.1328万册），电子图书38.87万册，中外文纸质期刊495种，引进了中国知网、万方医学网、百度文库（高校版）、读秀知识库、超星汇雅电子图书、EBSCO联采专题数据库、中文在线等13种数据库（共36个子库），镜像版电子图书171.6289万册。

截至2023年5月，学校与韩国加耶大学校、俄罗斯楚瓦什大学、英国兰开夏大学、加拿大圣克莱尔学院等中国国外高校建立了友好合作关系。与上海健康医学院、上海第十人民医院、苏州卫生职院、广州卫生职院等相关高校、医院开展合作交流活动。与宜秀区、潜山市、望江县、市卫健委签署战略合作框架协议。与省内外相关医院、药企、科研院所等开展“双主体”“现代学徒制”人才培养模式改革，推进产教融合、校企合作，与长三角高等药物研究院共建“现代医药产业学院”，与市高新区共建“药学产教融合实训基地”。

学校以亭子图案为校徽，颜色则采用体现生命与健康、繁荣与兴旺的绿色，寓意学校的事业发展充满生机和活力。

仁德 笃学 精业 济世

释义：品德是做人之本，学子要学会做事，更要学会做人；让“仁德”成为个人的基本遵循，一步一个脚印地前行；少说多做，多行好事，一点一滴地取得进步。锤炼出宽广胸怀和健全人格，让品德之光照亮人生航程，同时提升科学文化素质，熟练掌握专业技能，自尊自爱、自律自强，把自己造就成一个大气、大写的人。

严谨 求实 团结 奋进