热那亚贵族家庭出身，生于意大利的奥内利亚。1503-1506帮助叔父多梅尼科镇压科西嘉对热那亚的反抗，还曾率领自己出资装备的船队抗击过海盗的侵袭。1519年在皮亚诺萨(Pianosa)大败土耳其军队，后又支持法王法兰西斯一世对神圣罗马帝国皇帝查理五世作战。1527年在法军支持下夺得热那亚统治权。因法王未能履行承诺，而神圣罗马帝国皇帝查理五世答应给予热那亚自由权，乃于次年在查理五世帮助下将法国人赶出热那亚。在热那亚建立由大贵族共同掌权的寡头统治，结束内争，并被查理五世封为梅尔菲(Melfi)亲王和帝国舰队总司令(海军上将)。

他的军事才能帮助查理五世皇帝巩固了在意大利半岛的统治。但他在海上碰到一个难以对付的敌手，以阿尔及利亚为基地的奥斯曼帝国海军元帅海雷丁，他俩数度交锋，互有胜负，他曾在1535年协助查理五世把海雷丁赶出突尼斯（突尼斯战役），但也曾在1538年因瞻前顾后而在普雷韦扎海战惨败，1541年，安德烈亚·多里亚又未能成功夺取阿尔及尔。他是那个时代惟一能和海盗王海雷丁对抗的海军统帅，意大利王国安德烈亚·多里亚级战列舰就是为了纪念他而命名的。