截至2024年3月，该馆有馆藏文献总量305.53万册，涵盖所有学科。中外文纸本期刊保持在1600余种以上，电子图书259.48万种，数据库106种。世界著名的《科学文摘》（英国）、《生物文摘》和《化学文摘》（美国）、《文摘杂志》（前苏联）均有收藏。图书馆以古籍、徽州文书、民国时期文献为馆藏特色。古籍总量19.56万册，总藏量在省内仅次于安徽省图书馆而位居全省高校之首；善本古籍0.88万册，26部古籍入选《国家珍贵古籍名录》，37部古籍入选首批《安徽省珍贵古籍名录》，其中《洪武正韵》为国内唯一不配不补全本，元刻明递修《通志》、明嘉靖刻本《李太白全集》、《杜工部集》均为海内珍本；馆藏古籍尤以地方志收藏最为见长，拥有除海南省之外全国30个省市自治区的方志1.9万册，还有相当数量的徽州文书等地方文献；馆藏古籍以元刻本年代最早、明刻本最精，它们以其年代的久远、质量的精良和传世的稀少而显得弥足珍贵，已成为本馆馆藏的亮点和精髓。图书馆还拥有省内高校图书馆最丰富的一九四九年前报刊（8000余册）、民国图书（3.5万余册）。