2003年12月开始，企图跳脱所谓的Mystery（本格推理小说）的既有观念而大幅更新。封面插图的占有量增加、加入里封面（封面和一张插画），黑色调封底也改为柔和色调。内容增加恋爱要素，并在此类作品书腰写上大字的“L·O·V·E！”。

以建立和现有推理小说不同的“角色推理”为目标。此外，有独自的新人奖富士见Young Mystery大奖。

富士见ミステリー文库已在2007年废刊。不再出版新作，但仍有出版原先未完结作品（也有部份作品版权被转移）。

静流姊与执拗的死者们（上远野浩平/椋本夏夜）