对外承包工程公司在确保工程项目真实性的前提下，向商务厅申报对外承包工程出口货物。除提供对外承包工程合同外，还应提供“对外承包工程项目及出口货物批准书”(以下简称“工程货物批准书”)，列明工程项目下出口货物的名称、数量、出口额等相关情况。审核通过后，商务主管部门签发“对外承包工程项目及出口货物批准书”。

对外承包工程公司在货物报关出口并在财务上作销售处理后，向主管出口退税的税务机关报送《出口货物退免税申报表》和《对外承包工程项目及出口货物退税统计表》，同时提供购进货物的增值税专用发票或普通发票、税收(出口货物专用)缴款书、出口货物报关单(出口退税联)、“对外承包工程项目及出口货物批准书”申报办理退税。