1989年，香港政府公布香港机场核心计划，当中包括在小蚝北部穿过的北大屿山公路。最早期的北大屿山新市镇蓝图，小蚝也会成为新市镇的一部份，而香港地铁当时公布东涌线的早期方案，也计划将小蚝发展车厂、车站及上盖物业三合一发展。其后香港政府缩减北大屿山发展规模，优先发展东涌，故小蚝的发展需要搁置。

然而，为兴建北大屿山公路及东涌线的车厂，小蚝湾也需要被填海。目前该处有香港地铁小蚝湾车厂、龙运及城巴巴士厂、车辆扣留中心、愉景湾隧道等建筑物，极少人居住。