1983年10月，撤公社建小长山乡。

2017年，改小长山岛镇。

2011年末，小长山岛镇辖回龙、房身、复兴、英杰、虫巴蛸、乌蟒6个村民委员会，下设50个村民小组。

截至2020年6月，小长山岛镇辖6个行政村，镇人民政府驻回龙村郭家庙屯。

小长山岛镇地处长山列岛中间海域，东南与海洋岛相望，南与獐子岛相对，北邻大长山岛，全镇行政区域面积27.57平方千米。

小长山岛镇辖区岛呈东西走向，两端地势高，中部低凹，沿岸多礁，滩涂分布广。最高点位于大王山，海拔148.7米。

小长山岛镇属温带大陆性季风气候，其特点四季分明，气候温和，冬暖夏凉，季风明显，温差小，无霜期长。多年平均气温10.6℃。降雨集中在每年的4~10月，7月最多。

小长山岛镇的主要自然灾害为台风、风暴潮。最严重的一次风暴潮发生在2007年3月，打碎、打沉养殖船只1180余艘，1740余台养殖浮筏毁坏，2900立方水体的苗种和800立方饵料全部损失，网箱养殖损失400箱，各种贝类、海珍品损失150余吨；蔬菜大棚受灾2400平方米；电力设施遭到严重破坏，直接经济损失8500余万元。

2011年末，小长山岛镇辖区总人口12702人，其中城镇常住人口10961人，城镇化率86.3%。另有流动人口2682人。总人口中，男性6396人，占50.4%；女性6306人，占49.6%；18岁以下1892人，占14.9%；18~35岁3110人，占24.5%；35~60岁5546人，占43.7%；60岁以上2154人，占16.9%。总人口中，以汉族为主，达12577人，占99%；有满、蒙古、回、朝鲜等少数民族，共125人，占1%。2011年，人口出生率6.1‰，人口死亡率7.8‰，人口自然增长率-1.7‰，人口密度为每平方千米572人。

截至2018年末，小长山岛镇户籍人口12222人。

2011年，小长山岛镇财政总收入0.2亿元，比上年增长12.9%。一般预算收入521万元，比上年增长16.6%。

2011年，小长山岛镇农民人均纯收入2.2万元。

截至2018年末，小长山岛镇有11个工业企业，其中规模以上工业企业2个，有营业面积超过50平方米的超市或综合商店27个。

2011年，小长山岛镇有耕地面积2100.5亩。

2011年，小长山岛镇有玉米、薯类、豆类种植面积1799亩；蔬菜种植面积237亩。

2011年，小长山岛镇有海洋捕捞业有机动船只509艘；浮筏养殖规模6万亩，海珍品底播增养殖面积116万亩，网箱养鱼1200箱；海水增养殖产量7.5万吨；捕捞业产量3.1万吨。

2011年末，小长山岛镇金融机构各类存款余额5.7亿元。

2011年末，小长山岛镇境内有客货码头3座，客船4艘，客位829个，往返小长山岛、钯蛸岛、乌蟒岛、大长山岛和皮口港，年集散旅客21.5万人次。货运船只16艘。县级公路20.2千米，乡级公路46千米，均为混凝土路面。客车79辆，其中公交车6辆，出租车73辆。

2011年末，小长山岛镇有文化站1个，农家书屋6个，文化艺术演出团体6个。

2011年末，小长山岛镇有幼儿园5所，在园幼儿342人，专任教师24人；小学2所，在校生791人，专任教师65人，小学适龄儿童入学率100%；初中1所，在校生562人，专任教师44人，九年义务教育覆盖率达100%；中等职业学校1所，专任教师2人。

2011年，小长山岛镇教育经费达484.2万元，财政预算内教育经费340万元，分别比上年增长18.9%、7.9%。预算内教育经费（包括城市教育费附加）占财政总支出的比例为17%。

2011年末，小长山岛镇有各级各类医疗卫生机构9个，其中中心卫生院1所，村级卫生所6个，民营诊所2个。

2011年，小长山岛镇医疗机构（门诊部以上）完成诊疗15271人次。

2011年末，小长山岛镇有体育场地7处，经常参加体育活动的人员占常住人口的60%。

2011年，小长山岛镇有城镇最低生活保障户数220户，人数381人，支出156.8万元，月人均343元。国家抚恤、补助各类优抚对象32人，抚恤事业费支出30.7万元。

2011年末，小长山岛镇有有线电视用户4123户，电视综合覆盖率98%。

2011年末，小长山岛镇有邮政网点1个，乡村通邮率100%。固定电话用户3568户，电话用户普及率78.9%；宽带接入用户1200户。

因小长山岛镇辖区位于小长山岛而得名。