1997年，尹宗灿执导短片《Memento》，从而正式开启导演生涯。1999年，自编自导短片《风景》，该片讲述了两个男人对过往爱情的回忆。2001年，执导故事片处女作《毛骨悚然》，该片相继入围韩国青龙电影奖、波尔图国际奇幻电影节等诸多影展，尹宗灿更凭借该片获得第38届韩国百想艺术大赏最佳新人导演奖等多个奖项。

2005年，拍摄个人首部航空影片《青燕》，该片入围第42届百想艺术大赏、第43届韩国电影大钟奖、第20届全州国际电影节。2009年，执导玄彬、李宝英主演的故事片《我很幸福》，该片根据韩国作家李青俊的小说《赵万德先生》改编，被选为第13届釜山国际电影节的闭幕片。

2013年，自编自导励志片《我的帕瓦罗蒂》，该片由韩石圭、李帝勋主演；上映后，该片相继入围第49届韩国百想艺术大赏、第14届全州国际电影节、第37届蒙特利尔国际电影节，获得第27届福冈亚洲电影节最佳影片。