弘治三年（1490），以疾恳辞。

弘治四年（1491），得到批准，道闻母徐夫人丧。

弘治六年（1493），南院出缺，廷议以屠滽名上，特命还掌院进左都御史，加太子少保。以灾异陈二十事，多见采纳。宁化王罪干伦理，颇涉暧昧。遣官核实，逮至京师，言辞不服，屠滽指出其疑误，稍开其端，多所宽释。因父疾归，复乞终养不许。

弘治九年（1496），吏部出缺，廷荐四人，明孝宗亲书屠滽名付内阁，升吏部尚书，太子少保如故。屠滽博采舆论，务公黜陟，每考察见以丧去任者，非大过不去。注选至恶地，必停笔良久，务以土俗稍宜者补之。内降颇冗，以灾异执奏，言甚剀切。重建清宁宫成，诏西僧庆赞，屠滽率诸大臣力陈不可。又以彗星现，会奏十事，带头早视朝、勤听政。

弘治十年（1497），秩满，加太子太保。屠滽以双亲年逾八十，请求预赐封诰，许之。

弘治十一年（1498），朱厚照在储宫出阁进学，加太子太傅，进阶光禄大夫、勋柱国，赐麒麟服。

弘治十三年（1500），周经以户部尚书致仕，屠滽因召对言周经不宜退，虽忤旨不变，于是乞致仕，特赐勑给驿，令有司月给廪粟，岁给舆隶。一年后，居父丧。

弘治十八年（1505），明武宗即位，以诏例进阶特进荣禄大夫。

正德三年（1508），复勑召至京师，仍以太子太傅、吏部尚书兼左都御史，赐蟒衣、玉带及御制龙文诗、《历代通鉴纂要》。刘瑾窃政，都御史鞭笞侮辱御史以邀宠幸。刘瑾以此刺激屠滽，屠滽不肯有以私。刘瑾构陷兵部尚书刘大夏，欲置之死地，屠滽委曲调护，得到周全，刘瑾非常不满，再夺月俸，屠滽自度势不可支，复乞致仕以去。

正德七年（1512）九月，无疾而终，年七十二。明武宗辍视朝一日，赠太保。

屠滽的祖先是汴京人，跟随南宋南渡，迁淮阴，再迁无锡，最后定居于鄞县。

五世祖：屠季，定居于鄞县。

曾祖父：屠顺

父：屠瑜

李东阳：公体貌魁硕器，宇宏阔达，治体精法比。每值疑事大狱，对众属藁不烦窜，易然自处，谦逊未尝挟以骄人。