医院始建于1955年，前身为山东省麻风病研究所。

1960年与山东省性病防治所合并成立山东省皮肤性病防治研究所。

1968年开设皮肤科门诊。

1986年开设皮肤病病房。

1984年迁至现址济南市槐荫区经十路27397号。

1988年设立了市内第一门诊部。

1992年设立了市内第二门诊部。

2000年经山东省卫生厅批准，成立山东省皮肤病医院，院所合一。

2002年10月发展成为一所省属三级皮肤病专科医院。

2012年7月，被卫生部批准为国家临床重点专科建设单位。