更新时间：2024-10-25 14:00
1962年9月4日，山中伸弥出生于日本大阪府。高中考入大阪教育大学附属天王寺高中。
1987年3月，从神户大学医学院毕业；7月，担任国立大阪病院临床研修医生。
1993年3月，从大阪市立大学医学研究科博士毕业；4月，在美国格拉斯通研究所（Gladstone Institute）从事博士后研究工作。
1996年1月，担任日本学术振兴会特别研究员；10月，担任大阪市立大学医学部助手（药理学教室）。
1999年12月，担任奈良先端科学技术大学院大学遗传因子教育研究中心助理教授。
2003年9月，升任奈良先端科学技术大学院大学遗传因子教育研究中心教授。
2004年10月，担任京都大学再生医科学研究所（Institute for Frontier Medical Sciences）教授（再生诱导研究分野）。
2007年，担任格拉斯通研究所高级研究员；同年，担任京都大学综合细胞材料研究中心教授。
2008年1月，担任京都大学物质—细胞统合系统据点iPS细胞研究中心长。
2010年，担任京都大学iPS细胞研究所所长。
2012年10月，获得诺贝尔生理或医学奖；同年，当选为美国国家科学院院士。
2020年，担任京都大学iPS细胞研究财团法人。
2022年，担任京都大学iPS细胞研究与应用中心名誉主任。
2006年，山中伸弥等科学家把4个转录因子通过逆转录病毒载体转入小鼠的成纤维细胞，使其变成多功能干细胞（iPScell）。这意味着未成熟的细胞能够发展成所有类型的细胞。山中伸弥从其他科学家已经公布的研究结果中挑选出24种最有希望的转录因子。在试验室中他发现这24种转录因子中的确有4种转录因子可以将人体细胞重组成干细胞。他把4种基因注入皮肤细胞，从而得到“鸡尾酒”iPS细胞。事实证明这4个转录因子中，其中一个转录因子确实是“一次天大的冒险”，因为这一个是与癌症相关的转录因子。数月后他又发现即使不使用这个致癌基因，他仍然能够重组细胞，这样癌变的几率会大大降低。但新创造的干细胞仍然会发生癌变，在他的实验中，121只老鼠中，有20%产生了肿瘤。这说明使用逆转录病毒，可能使基因产生变异，引发肿瘤等副作用。他表示下一步的研究目标是在不使用逆转录酶的情况下实现细胞重组。发现了iPS细胞iPS细胞又被称为“万能细胞”，它最大的优势，是能够再生人体器官。
2007年，山中伸弥所在的研究团队通过对小鼠的实验，发现诱导人体表皮细胞使之具有胚胎干细胞活动特征的方法。此方法诱导出的干细胞可转变为心脏和神经细胞，为研究治疗多种心血管绝症提供了助力。这一研究成果在全世界被广泛应用，因为其免除了使用人体胚胎提取干细胞的伦理道德制约。
根据2023年6月京都大学iPS细胞研究所网站数据，山中伸弥在《自然（Nature）》《科学（Science）》等学术期刊上先后发表论文150多篇。
Ikeda, H., Sone, M., Yamanaka, S., and Yamamoto, T. Structural and spatial chromatin features at developmental gene loci in human pluripotent stem cells. Nature Communications 8(1): 1616
Morizane, A., Kikuchi, T., Hayashi, T., Mizuma, H., Takara, S., Doi, H., Mawatari, A., Glasser, M.F., Shiina, T., Ishigaki, H., Itoh, Y., Okita, K., Yamasaki, E., Doi, D., Ono,e H., Ogasawara, K., Yamanaka, S., and Takahashi, .J. MHC matching improves engraftment of iPSC-derived neurons in non-human primates. Nature Communications 8(1): 385
Takahashi, K., Tanabe, K., Ohnuki, M., Narita, M., Sasaki, A., Yamamoto, M., Nakamura, M., Sutou, K., Osafune, K., and Yamanaka, S. Induction of pluripotency in human somatic cells via a transient state resembling primitive streak-like mesendoderm.(2014). Nature Communications 5, 3678.
Maekawa, M., Yamaguchi, K., Nakamura, T., Shibukawa, R., Kodanaka, I., Ichisaka, T., Kawamura, Y., Mochizuki, H., Goshima, N., and Yamanaka, S. Direct reprogramming of somatic cells is promoted by maternal transcription factor Glis1.(2011). Nature 474, 225-229.
Okita, K., Matsumura, Y., Sato, Y., Okada, A., Morizane, A., Okamoto, S., Hong, H., Nakagawa, M., Tanabe, K., Tezuka, K., Shibata, T., Kunisada, T., Takahashi, M., Takahashi, J., Saji, H., and Yamanaka, S. A more efficient method to generate integration-free human iPS cells. (2011). Nature Methods 8, 409-412.
Yamanaka, S., and Blau, H.M. (2010). Nuclear reprogramming to a pluripotent state by three approaches.Nature 465, 704-712.
Hong, H., Takahashi, K., Ichisaka, T., Aoi, T., Kanagawa, O., Nakagawa, M., Okita, K., and Yamanaka, S. (2009) Suppression of induced pluripotent stem cell generation by the p53-p21 pathway. Nature 460, 1132-1135.
Aoi, T., Yae, K., Nakagawa, M., Ichisaka, T., Okita, K., Takahashi, K., Chiba, T., and Yamanaka, S. (2008). Generation of pluripotent stem cells from adult mouse liver and stomach cells. Science 321, 699-702.
Okita, K., Nakagawa, M., Hyenjong, H., Ichisaka, T., and Yamanaka, S. (2008). Generation of mouse induced pluripotent stem cells without viral vectors. Science 322, 949-953.
Okita, K., Ichisaka, T., and Yamanaka, S. (2007). Generation of germline-competent induced pluripotent stem cells. Nature 448, 313-317.
Fukuhara A, Matsuda M, Nishizawa M, Tanaka M, Matsuki Y, Murakami M, Ichisaka T, Murakami H, Watanabe E, Takagi T, Akiyoshi M, Ohtsubo T, Kihara S, Yamashita S, Makishima M, Funahashi T, Yamanaka S, Hiramatsu R, Matsuzawa Y & Shimomura I. Visfatin: A Protein Secreted by Visceral Fat that Mimics the Effects of Insulin. Science 307: 426-430, 2005
Mak W., Nesterova TB., de Napoles M., Appanah R., Yamanaka S., Otte AP, and Neil Brockdorff N. Reactivation of the Paternal X Chromosome in Early Mouse Embryos. Science 303: 666-669, 2004
Takahashi K, Mitusi K. and Yamanaka S. Role of ERas in promoting tumor-like properties in mouse embronic stem cells. Nature 423: 541-545, 2003.
美国加利福尼亚大学旧金山分校教授及下属的格拉德斯通研究所高级研究员。
山中伸弥的父亲经营着一个生产裁缝机零配件的小工厂，虽然他小时候也喜爱分解机械，但常常无法将其恢复原样，受到父母的责备。机械道路上的不顺利，成为他迈上医学道路的另一个诱因。
山中伸弥高中3年期间因为练柔道就受伤了10多次（骨折），他的父亲告诉他：“你多次受伤，看见医生这么为病人减轻痛苦，你将来要成为医生为人类服务。”于是他就接受了父亲的提议，在学校的最后阶段认真学习，考入了神户大学医学部，准备以后做一名骨科医生。
大学毕业做临床实习期间，山中伸弥发现自己对手术其实没有什么天分，别人做20分钟的手术他两个小时也未必完成；并且他觉得做医生再优秀也只能帮助少数的病人，而医学研究有成果的话通常可以帮助更多的病人，所以他的兴趣转向基础医学研究。
山中伸弥利用iPS细胞先后再生出人体皮肤、眼膜等成为世界iPS细胞的研究权威。
山中伸弥对医学科研做出了杰出贡献。（香港中文大学评）