1978年升任教授。现任国际日本文化研究中心教授、研究调整主干；兼任京都大学人文科学研究所教授。1990年被聘为中国科学院自然科学史研究所名誉教授。因有关日本古代思想家三浦没团员之研究，获第15届大佛次郎奖；因对中国古代医学史的研究，获第一届A. L. Basham Medal奖。

山田庆儿先生早年专修天文学，带着“与西欧诞生之科学不同的另一种科学是否成立”这样的疑问，开始转向中国哲学和中国科学史的研究，主要著作有：《古代东亚哲学与科技文化》（中文版）、《历史の中の病と医学》、《中国医学の思想的风土》、《东アジア本草と博物学の世界》等。在中国哲学、医学发展史的研究方面具有独特的见解。