后因宫村，伊藤的奇怪表现得出结论：山田的互换身体能力消失，变成了俘获他人的心的能力。（让别人爱上自己）

之后得知小田切宁宁拥有接吻后俘获他人内心的能力，但和山田接吻后不仅没让山田爱上自己，反而自己爱上了山田。在白石的推理下得出：白石丽拥有互换身体的能力，小田切宁宁拥有俘获他人内心的能力，山田龙拥有复制他人能力的力量。再次与小田切接吻后解开了能力，使小田切对山田的爱意消失。

后来因五十岚潮的帮助了解到学校内的魔女传说，魔女在学校内代代相传，每一个魔女都有一个能力。在校园笔记上半册的记载中记录了两种能力：俘获的能力（小田切宁宁），思念的能力（未知）。得知校内有其他魔女存在的山田，打算与其他三人共同寻找魔女。

超自然研究部一行人为了解学校魔女的秘密而出发去集训地【俱乐部会所】寻找校园笔记下半册的记录。然而因山田成绩不佳而被迫进行假日补习。回到宿舍，一行人继续对魔女能力进行研究，得出结论：多个魔女的能力不能同时作用于一人身上。

翌日，山田为了脱离补习而与白石互换，让白石替自己考试。同样补习的大冢芽子在出门后亲吻了山田（内在为白石）。白石与山田互换回身体后表示大冢芽子可能是魔女，让山田亲自与她接吻复制能力。翌日的考试，（由于之前亲吻的对象内在为白石，魔女能力重叠导致大冢芽子能力没有成功）所有人和平常一样的成绩。在白石丽的帮助下，山田成功与大冢芽子接吻，复制了大冢的能力。

第二天早上，山田的脑中传来了大冢芽子的声音，在了解情况后得知大冢芽子的能力为思念的能力（这里的思念是思想意念的意思，并不是动词的思念）—即心灵感应。与宫村接吻后通过心灵感应将题目传送给宫村，再由宫村报出题目给白石解答，由宫村将答案传给山田，山田传给大冢芽子，再传给其他人的方式成功使所有人通过补习。大冢芽子在最后表示自己喜欢内在为白石的山田。

补习过后的一行人却没有找到学校笔记的下半册。然而大冢芽子却说出了另一位可能是魔女的人……

根据大冢芽子提供的线索，山田来到魔女——猿岛玛利亚的家中，而猿岛玛利亚因长时间不来学校，作为学生会的宫村也一同来调查。本想偷偷潜入的两人却被猿岛玛利亚本人撞见，并被邀请进家中。提出想和山田单独说话后，向山田透露自己有预知未来的能力，并表明看到了自己被当作学校纵火犯的未来，为避免这样的未来发生便不再去学校。山田离开时与猿岛玛利亚接吻，复制了预知未来的能力。

来到学校后，经过一番实验得出：只能预知自己的未来，但无法改变。在预知白石摔下楼梯的未来后，了解到：通过魔女能力的干涉可以改变未来。

第二日，为获得更多的火灾线索而与众人接吻，并通过心灵感应能力将画面传送给大冢，让其画出。得出：能力为可以看到以接吻对象为视点的自己的未来的能力。根据这一线索，找到当初与猿岛玛利亚接吻看到纵火影像的椿剑太郎。因了解该人经常情绪低落时在旧校舍炸天妇罗，而断定椿剑太郎为真正的纵火犯。其表明要和白石表白，如果失败就要在旧校舍炸天妇罗，为避免火灾发生众人一同计策用互换身体的能力进行干涉。

翌日，山田与白石互换拖延时间阻止火灾发生。却在最后关头失败，伤心欲绝的椿跑到旧校舍准备炸天妇罗，在最后关头因白石的原因，让山田抓住机会趁机与椿接吻互换身体，从而阻止了火灾。了解能力秘密的椿剑太郎也加入了超自然现象研究部。至此，研究部的5人到齐。

为了文化祭的开店，作为条件，学生会长山崎春马要求山田等人去管理一些低年级生，并表明该群体的头目是魔女。山田动身去找该群体头目——泷川诺亚谈话，却被对方说恶心，山田伤心归去并表示下次一定要复制到泷川诺亚的能力。

山田再次去找泷川诺亚，并让对方得知魔女的事情，然而泷川诺亚却变得非常奇怪，事后把超自然现象研究部砸得乱七八糟。愤怒的山田来到学生会，从会长那里得知泷川诺亚拥有校园笔记下册，并得知泷川诺亚的目的是消灭其他魔女。

为了阻止泷川诺亚的计划，山田将4位魔女集结起来，并告知泷川诺亚的目的，希望他们暂时不要使用能力。

作为泷川诺亚手下的深泽芽子，向泷川诺亚说出认为白石丽是魔女，并通过推理得出白石的能力是身体互换，早有预谋的三人打算利用身体互换用白石的身体进行破坏从而让白石退学。深泽芽子来到超自然研究部强吻白石后成功互换，却不知白石已跟山田互换而反被山田抓住。为了防止被俘获内心的能力拉拢，泷川诺亚手下的三人表示不会再干涉，过普通的校园生活。

为了引诱泷川诺亚拿出校园笔记下册，山田等人互换成泷川诺亚手下三人，却被识破。事后，泷川诺亚为了让山田明白一切的真相而与山田接吻，使其复制自己的能力。当晚，山田做了一个关于泷川诺亚过去的梦。

后找到泷川诺亚得知，其能力为：在梦中看到接吻对象内心受到伤害的过去。山田表示自己会帮助泷川诺亚，自己一直孤军奋战的泷川诺亚受到感动，并拜托山田帮助自己。

此后，泷川诺亚经常黏着山田。误以为山田对泷川诺亚使用俘获内心能力的手下三人，将山田打晕并捆绑。挣脱以后，山田向三人坦白，说出泷川诺亚的心声，另三人打开心扉，并表示不再做坏事，要向前迈进。解决了事情后，泷川诺亚向山田表明，自己喜欢山田。

学生会即将从学生会候补中挑选下一届学生会长，学生会候补有，一直帮助山田的宫村，拥有俘获内心能力的小田切，以及一个未知人物玉木真一。

猿岛玛利亚向山田提出希望能消除自己预知未来的能力，山田为此向拥有校园笔记下册的泷川诺亚求助，并得知玉木真一拥有夺取他人能力的力量。并向山田展示了自己夺取到的透明人的力量。

同时，为了打听下届学生会长的情报，山田打算复制小田切的俘获内心的能力对学生会长使用。在即将强吻时，被学生会长秘书飞鸟美琴打晕，并关入小黑屋中，对山田进行施虐，一时之下对飞鸟美琴使用俘获内心的能力，却使飞鸟美琴的抖S倾向完全爆发，迫不得已的山田解除了俘获的能力，在山田说出想要消除魔女能力后，飞鸟美琴给他松了绑，并表示自己是请玉木真一消除了自己作为魔女的透明人的能力。

山田见到了会长，然而学生会长表示自己还没决定好下届学生会长人选，于是打算以游戏决定。学校一共有7位魔女，已找到6位，三位学生会长候补中最先找出第7位魔女的人便是下届学生会长。

三人动身去寻找最后一位魔女，然而山田在和猿岛玛利亚接吻时看到了不愿发生的未来，为了阻止未来发生，必须要让宫村成为下一届学生会长。再后来与宫村的交谈中山田表明自己喜欢白石，为了能够找到最后一位魔女，宫村透露自己的姐姐可能知道具体情况，山田于是来到了宫村家。

然而宫村姐姐脾气却十分差，后山田得知宫村姐姐正是因为寻找最后一位魔女的事才会变成这样，并说出第7位魔女和所有魔女都不是一个档次。超自然研究部5人一同动身在学校寻找魔女，然而没有魔女能力的宫村，伊藤，椿却被玉木真一用了透明人的能力，使其一直在窃听魔女情报，最终被山田发现。

而泷川诺亚却将山田叫到屋顶，并向他说出自己的发现：魔女的能力都是在学校内部不断更换主人进行循环，而第7位魔女却一直没有循环。

山田与白石进行身体互换，从而打算借此改变未来。用白石的身体再次见到宫村姐姐，而宫村姐姐却表示寻找第7位魔女要有相当的觉悟，并表明山田可能会因此再也见不到白石。自己也是因为要逃避第7位魔女的追捕才逃离学校躲在家中。山田最后得知，如果同时知道7位魔女的名字，有关魔女的一切记忆将会被消除。山田向众人道别后，独自一人来到了学生会。

说出了第7位魔女的名字后，山崎承诺下一届学生会长将由宫村来担当。

与白石做完最后的交谈后，山田独自一人在草坪休息，而第7位魔女——西园寺理香来到旁边，将山田的记忆进行消除，并表明将在一天内生效。

第二天前去上学的山田却并没有忘记一切关于魔女的事情，欣喜若狂的他正准备进入超自然活动室时却发现一切他认识的人都忘记了他的存在。被忘记的山田努力做出事情想亲近一行人，却并不成功，孤身的他决定一人生活。此时玉木真一找上了山田，希望与他成为同伴，然而真正的原因却是因为无意中听山田说出了第7位魔女的名字，因而有关他人自己的记忆也同样都被删除。

在空教室打扫的山田却遇到了回来拿东西的白石，面对忘却自己的白石，一直将感情隐藏在心底的山田对她说出“请和我交往”，却被白石拒绝并表示已有喜欢的人了。

为了取回大家的记忆，山田来到学生会，然而会长表示没有取回记忆的方法，并表示曾经受山田影响的魔女因忘记了山田而发生了不好的改变。失落的山田在回去时却碰到了失去记忆的小田切，小田切约山田在放学后见面，本没有赴约的山田看到一直苦苦等待的小田切，并且在玉木真一的怂恿下，前去见小田切，进行接吻，复制了俘获人心的能力，第二天小田切的记忆却恢复了，得知与魔女接吻便可恢复记忆的信息后，利用多种办法恢复了猿岛玛利亚，小田切宁宁，大冢芽子，泷川诺亚4人的能力，并从宫村姐姐那里得知集齐7位魔女后就可以进行仪式许下愿望，可以借此恢复所有人记忆。而学生会长却为了阻止计划而让飞鸟与白石互换，使山田无法找到白石，在宫村姐姐的帮助下让失去记忆的宫村与山田一道解救了白石，并且抓住了飞鸟美琴。

已经集齐6位魔女的山田为了让西园寺理香加入而去与其交谈，而西园寺理香的条件是消除宫村姐姐的记忆，为了能让所有人的记忆恢复，宫村姐姐与西园寺理香见面，被消除记忆后，西园寺理香加入山田他们。

集齐了7位魔女的山田在仪式上许下愿，希望能恢复所有人的记忆，并消除学校魔女的能力。所有人的记忆回来了，被告知魔女能力消失后，所有魔女表示以后会过上普通的校园生活，并与所有角色一同开了一场派对。最后山田向白石表白，被白石说自己喜欢的人就是山田，于是两人成功交往。

宫村被选为新学生会长，山田被任命为秘书，并通过选拔方式选出了两名副会长。学生会成员集体前往俱乐部会所，却被山崎告知学校魔女的能力并没有消失。由于7位魔女的能力被仪式消除，因而在校内诞生了7位新魔女。了解情况的学生会决定一同寻找新的魔女。

校园笔记上下两册被人偷走，心里起疑的泷川诺亚猜测出新魔女的诞生，并告知自己在调查中发现的新魔女绀野翼。前去调查的山田猜测是小田切的俘获能力，然而却有一丝起疑，之后共同叫上小田切是秘密调查，发现绀野翼的能力与俘获并不相同，最后认为是绝对命令的新能力。过度使用能力的绀野翼渐渐开始依赖能力，前去劝阻的小田切却反被施加能力，为了拯救绀野翼，山田通过劝阻让绀野翼意识到自己能力的危险，并使之打开心扉，在成功复制到绀野翼的绝对命令后，命令她解除所有能力，并且勇敢向前决不能认输。绀野翼也因此受到感动，并且不再依赖能力，与队友融洽相处，共同努力。

在回家路上的山田被南茜等人突袭，南茜以为学生会想利用绝对命令的能力预谋不轨，当山田说出自己只是想拯救别人时，对方松开了手，而经过山田的叙述了解到其中一人正是第7位魔女，并和山田一样想帮助陷入危险的魔女。山田希望能与其成为同伴，而要求是离开学生会并且帮助调查一个人。

暂时离开学生会的山田来到南茜所指派调查的人——萌黄小鸟，并被告知此人对全班施加了能力。在午休时段，山田通过布偶成功与萌黄小鸟进行对话，通过调查了解到其能力为读心术，并在之后的周末，被作为陪伴的谢礼而与山田接吻，成功复制读心术的能力。却因沉迷能力乐趣而险些被能力吞噬，及时醒悟的山田认识自己错误，并在最后再次与小鸟接吻，解除小鸟对自己读心术的能力。萌黄小鸟在事后告诉宫村她们几人的能力在仪式前就已存在，意味着最新诞生的7位魔女并未找到，具体情况不明。

由于自身还留有读心术的能力，而愁苦无法与白石接吻，为了复制更方便接吻的能力，前去求助却遭南茜拒绝，然而作为南茜的同伴的希德因为十分了解山田的心情而帮忙，并告诉了他预知未来的魔女——筑紫爱子。得知用钱就可以接吻的山田前去找筑紫爱子，却因费用太高无法接吻，毫无计策的山田只好与筑紫爱子共同进行工作，并在最后成功接吻，复制到预知未来的能力。

事后，山田遇到退学危机，为了使最后的考试通过避免退学，而向南茜求助，并从清集院桃子那里成功复制互换身体的能力，并与白石互换通过了补考退学危机。

新年前夕，山田为白石庆祝了生日。之后超研部一起度过了新年。

新学期开始，黑崎仁发现自己无法通过山田交换身体，最后证实自己成为了魔女。学园再一次出现新一组魔女，这一组才是白石，小田切等人能力真正的继承者，并且这次的魔女全是男生。

不久，第七位魔女（魔男）诧摩类主动找上山田等人，但他并没有消除山田等人记忆，而是和山田等人融洽的谈话，让人诧异不已。

新魔女的能力逐渐显现，伊藤首先在无意中，中了不明的能力。白石发现自己也中了相同能力，为了不伤害山田，选择主动远离了山田。众人在山崎春马提示下来到资料库，推测新的魔女使用能力的手段不一定是接吻，并且山田拒绝了诧摩类联手的请求。

通过黑崎的能力，山田对照小田切的记忆，发现自己的记忆曾被人修改。五十岚和小田切当年并未陷害山田。得知山田内心的小田切对山田说：“如果你被白石同学甩掉，就请来我这里吧。”

一大批学生要求驱逐现任学生会，宫村推测这是受了魔女能力的影响。萌黄的能力被魔女杀手夺走，而这个新的魔女杀手正是五十岚潮。山田与椿互换身体前去调查，发现飞鸟也参与了这次事件。这次调查得知了魔女一条正宗的能力是煽动他人的不满，不满的目标就是现任学生会。山田前往将棋部询问五十岚，五十岚则表示推翻学生会只是计划的一环，他真正的目的是得到期望之物。

山田和玉木打算夺取一条的能力，两人在经过白石家时，发现将棋部的一条和三浦悠里在白石家门口，一番缠斗后，对方告诉山田他们想消除白石身上中的能力，而施加上三浦悠里的能力。三浦希望山田等人放弃夺取一条的能力，而自己也不会去给白石施加能力。山田要求对方解除白石中的能力，但遭到拒绝。但不知为何，三浦最后以头槌的方式将自己的能力复制给了山田，并表示这个能力只能对一个人用一次，山田这么坚持，以后总会后悔。

山田虽得到了三浦的能力，却完全不知道这究竟是什么样的能力，众人展开了无厘头的实验，而志愿成为实验对象的诺亚深受其害。最后诺亚发现即便对方施加能力是靠头槌，而到了山田这里仍然还是要靠接吻施加。第二天早晨，山田出现幻觉，在幻觉中看到并控制了诺亚的行动，得知三浦的能力是让被施加者按照自己的想法行动。

将棋部的煽动还是起了效果，学生会不信任案签名过半，学生会罢免条件成立，不久将通过选举产生新的学生会。看着只有椿一人在超研部炸着天妇罗，山田和宫村心里很不是滋味，两人同时决定选举过后，退出学生会，回到超研部，而宫村把会长竞选的大任交给了玉木，煽动目标是宫村，如果换成玉木，那么一条的能力就会不攻自破。

玉木对自己能否当上会长产生动摇，但还是坚定了自己的信念。山田与宫村决定依靠诺亚探听将棋部，却因为山田和诺亚两人全不会将棋，一场棋局测试后被赶了出来。山田发现将棋部有一位只是被单纯利用的普通人八十岛香。八十岛和诺亚向来不和，诺亚利用这一点让山田对八十岛施加了能力。山田通过能力看到八十岛不但在将棋部被排斥，在学校也是一样，山田最后还是毫不犹豫的为八十岛解了围。经过山田的开导，八十岛离开了将棋部，并交到了朋友，八十岛感谢了山田并对诺亚道了歉。

通过八十岛给的情报，大家得知了三浦有一个很在乎的人，和山田同年级手艺部的姬川空。山田决定用能力控制姬川，却发现自己对姬川有种难以表达的感情，这种感情毫无疑问就是喜欢。山田在和姬川接吻后发现自己获得了新的能力，南茜故意隐瞒了姬川是魔女的真相。经过一系列推理，大家得出姬川的能力是看到对方有关心爱之人的记忆，而姬川的记忆曾被人消除，那个人正是南茜。山田等人找到三浦，希望了解消除记忆前的姬川，因为山田所看到姬川心中的心爱之人就是自己。三浦看到山田已经走到这步，告诉山田他们的目的就是讲学校恢复原本的样子，山田也决定要通过仪式找回自己失去了一年的记忆。无论过去和姬川关系如何，对他最重要的人是白石。

山田找到南茜希望她帮助自己决定仪式，南茜则只是让山田不要再靠近姬川。在山田的逼问下，南茜说出自己如此执着是因为和记忆消除前的姬川的约定。山田冷静下来，去找了姬川。这时白石因为身上能力被解除回到了学校，而姬川因为接吻也恢复了以前的记忆。白石通过接吻得知山田的心爱之人就是自己，并鼓励山田，这次为了山田自己取回记忆。

山田告诉姬川自己想要恢复过去的记忆，却被姬川赶了出去。山田和南茜谈起了魔女，南茜说山田还是和以前一样为了别人不断努力。姬川决定和山田的关系做个了断，同意举行仪式。但萌黄的能力已经被夺走，山田，宫村，诺亚三人决定突袭五十岚，对方却一口答应归还能力。条件是观看仪式过程，并在仪式后再次夺走一位魔女的能力。五十岚告诉山田，山田在拼命取回记忆的同时只会变得不幸。

魔女仪式结束后，山田并没有完全恢复记忆。但通过已经得到的记忆，得知山田和姬川早在一年级第一学期就已经认识，之后他人被南茜找上一起研究魔女，不久五十岚和小田切也加入了研究魔女的队伍。南茜告诉山田，当初他救得女学生不是小田切，而是自己，但情急之下她消除了在场三人的记忆。

面对山田，姬川，五十岚，小田切曾经关系要好的事实，山田还是选择了阻止五十岚的计划。白石问山田，自己和姬川两个人，山田会选择谁，山田选择了白石。五十岚告诉小田切他人曾经是恋人，小田切半信半疑中在家里找到了自己失去记忆前的手艺部的物品，里面装的正是山田的照片。小田切也决定阻止五十岚的计划。五十岚仍然决定实施计划，打算按照约定夺取南茜的能力。五十岚给了南茜一天时间去处理善后事宜，南茜告诉山田，他没有完全恢复记忆也是因为自己的关系。山田和南茜接吻复制了南茜的能力，之后希德找上山田，希望山田能让南茜成为山田的观测手并解释了什么是观测手及怎么成为观测者，山田这才诺亚已经成了自己的观测手。

和恋人白石丽十年后结婚，育有一子一女