1979年7月27日，经国务院批准大寨农学院并入山西农学院；同年，山西农学院更名为山西农业大学，被列为全国重点高等学校。

2001年5月，挂牌成立运城农学院、太原园艺学院、太原畜牧兽医学院、平遥机电学院、原平农学院、朔州职业技术学院6个二级学院。

2012年，学校成为山西省人民政府和农业部共同建设的高等学校。2013年，入选国家级大学生创新创业训练计划实施高校。2014年9月，学校入选第一批卓越农林人才教育培养计划改革试点项目。2016年，被评选为首批“全国深化创新创业教育改革示范高校”。

2017年，学校入选全国首批深化创新创业教育改革示范高校；同年，学校获批全国农业农村信息化示范基地；同年，学校获得留学生招生资格。2018年，学校被认定为山西省第二批省级大众创业万众创新示范基地。同年，入选中西部高校基础能力建设工程。

1953年，山西省在太原许坦村成立省农场。1954年，试验研究机构与推广机构分离，省农场改组为综合试验站。1955年，改为山西省农业科学研究所。1959年2月21日，升格为山西省农业科学院，各地农科所均属于省农科院体系。粉碎“四人帮”后，山西省政府将下放地方的农科所，以及果树、畜牧两所先后收归省农科院。山西省农业科学院是省政府直属的公益型科研事业单位。

2019年10月，山西省委省政府决定，山西农业大学和山西省农业科学院合署改革，成立新的山西农业大学。

2020年10月，山西农业大学草业学院揭牌成立；

2021年5月15日，成为高等农林院校课程思政联盟理事会员单位；

2022年6月17日，山西农业大学阳泉富硒产业研究院揭牌成立，该研究院由阳泉市政府和山西农业大学共建。

2023年4月，山西农业大学左权核桃产业研究院揭牌成立；5月18日，山西农业大学安全应急学院揭牌仪式举行。6月9日，山西农业大学河曲特优农业产业发展研究院在河曲县举行揭牌仪式。11月22日，学校学术委员会主任委员、生态环境产业技术研究院首席科学家、资源环境学院研究员徐明岗当选为中国工程院院士，成为学校首位中国工程院院士。

2024年4月3日，山西农业大学阳曲城郊农业产业研究院成立并揭牌。10月17日，山西农业大学产业研究院联盟成立。10月24日，山西农业大学（大宁）苹果产业研究院挂牌成立。

截至2024年5月，学校（院）设有教学单位22个，直属科研院所（中心）20个，开设本科专业68个，学科专业涵盖了农学、理学、工学、经济学、管理学、文学、法学、艺术学等8个门类。

截至2024年5月，学校（院）有9个博士后科研流动站，9个博士学位授权一级学科，1个博士专业学位授权类别；13个硕士学位授权一级学科，8个硕士专业学位授权类别。现有1个国家重点（培育）学科，9个省级重点学科。植物学与动物学、农业科学、环境与生态科学三个学科进入ESI全球前1%。

截至2024年5月，学校有教师、科研人员及职工4374人，其中正高级专业技术人员517人，副高级专业技术人员1443人，博士生导师175人，硕士生导师1196人。现有中国工程院院士1人，国际欧亚科学院院士1人，“长江学者”特聘教授1人，“国家杰出青年科学基金”获得者2人，国家高层次人才特殊支持计划领军人才项目获得者1人、教学名师项目获得者1人，“国家优秀青年科学基金”获得者1人，百千万人才工程国家级人选4人，教育部“新世纪优秀人才支持计划”入选者3人，国务院学位委员会学科评议组成员1人，享受政府特殊津贴83人，国家现代农业产业技术体系副首席2人、岗位科学家17人，农业农村部农业科研杰出人才2人、神农青年英才3人，“青年三晋学者”7人，省青年拔尖人才8人，省学术技术带头人63人，省科技功臣6人。国家级教学名师1人，全国优秀教师3人，教育部高等学校教学指导委员会委员11人，全国林业和草原教学名师2人，省级教学名师29人。

2023年8月1日上午，中国农业科学院作物科学研究所党委书记、副所长刘录祥研究员受聘担任学校小麦研究所学术所长。同年11月22日，徐明岗当选为学校首位中国工程院院士。

截至2024年5月，学校（院）有国家一流本科专业建设点14个，国家级特色专业建设点5个，国家级精品课程2门，国家级精品资源共享课程1门，国家级实验教学示范中心3个，国家级大学生校外实践教育基地1个。

截至2024年5月，近年来，学校（院）先后获得国家级教学成果二等奖2项、省部级及以上教学成果奖100余项，在“挑战杯”等竞赛中获得省部级及以上奖项200余项。

截至2024年5月，学校（院）积极推进对外合作交流，与美国欧柏林大学有长达百余年的合作历史；与美、英、澳、俄、泰等国家和地区的100余所高校建立了合作关系；与美国加利福尼亚大学戴维斯分校、新西兰梅西大学和奥克兰理工大学等知名高校开展联合培养项目；有尼泊尔、伊朗、巴基斯坦等国家的学生来校攻读学位。

截至2024年5月，学校拥有8个国家级平台，159个农业农村部学科群重点实验室、省重点实验室、省“1331工程”创新平台等省部级平台（基地、资质），38个科技部、农业农村部和山西省科技创新团队。

截至2024年5月，“十三五”以来，获得国家科技进步奖二等奖3项，省部级一等奖17项、二等奖83项；取得国家审（鉴）定品种53个、省级审（认）定品种506个，国家标准4个、行业标准5个、地方标准466个，国家植物新品种权73项。主管主办《山西农业大学学报（自然科学版）》等7本出版物。

2022年，学校（院）获批国家自然科学基金项目60项，总量比2021年翻了一番，新增国家审定品种等各类科研成果254项，新增山西省科学技术奖一等奖2项。

截至2024年5月，有纸质藏书218万余册，电子图书388万余册。截至2020年，图书馆内设各类阅览室12个，配置座位目前已达到2356席，引进与自建数据库74种，OA及NSTL免费资源近50种，包括图书、期刊、学位论文、音视频等多种文献形式，包含全文数据库、文摘数据库、事实数据库、多媒体数据库等多种类型。

《山西农业大学学报（自然科学版）》创刊于1936年，是由山西农业大学主管、主办的农业科学类综合性学术期刊。学报设有农业生物技术、资源环境保护、动物科学、果蔬科学、食品科学工程、农业机械化、林业科学研究等栏目；学报是中国科技核心期刊、RCCSE中国核心学术期刊、北京大学《中文核心期刊要目总览》（2017年版）来源期刊，被美国《化学文摘》（CA）收录。

《山西农业大学学报（社会科学版）》是山西农业大学主管、主办的综合性人文社会科学学术期刊。学报设有三农问题研究、政法理论、经贸论坛、管理科学、语言文学、农史研究、农技推广、高教研究等栏目；学报是中国人文社会科学引文数据库（CHSSCD）来源期刊、《科学引文数据库》（SCD）来源期刊、《中国人文社会科学期刊AMI综合评价》A刊扩展期刊。

勤奋、求实、团结、进取

甘于奉献、敬业乐教

勤奋学习、注重实践

崇学事农、艰苦兴校

截至2024年5月，学校（院）有农民之子社团、昆虫爱好者协会、剪韵艺社、功能农业社团、飞羽毽球社、大学生英语爱爱好者协会、Python爱好者协会等学生社团。

农民之子社团成立于2009年，其社团宗旨为服务三农，服务在校大学生，开展过募捐军训服、绿色感恩绿色离校、快乐星期天之支教活动、绿色漂流瓶、团建活动、关爱凤凰山等特色活动，并2019年12月在第十届校园文化节获得“优秀社团”称号。

昆虫爱好者协会成立于2019年，其宗旨为真诚的对待每个社团成员，认真的筹办每次活动，让社员在这里可以有所收获，可以交到朋友学到东西，曾开展过社团见面会、昆虫标本制作、昆虫饲育、野外采集等特色活动。

剪韵艺社成立于2005年，其宗旨是传承民间艺术，弘扬民族文化，开展过团花剪纸、十二生肖、剪纸摄影等活动，在2019年荣获第十届校园文化节优秀社团称号。