初受学于俞樾，与章太炎同门，治校勘训诂之学。后受康有为《新学伪经考》的影响，专治今文经学，成为近代今文经学的代表之一。

经钱玄同推荐，崔适于1914年秋季进入北京大学哲学门任讲师，并由北大出版部印成了《史记探源》《春秋复始》《论语足征记》。所著《春秋复始》，以《春秋谷梁传》为古文；《史记探源》，以《史记》本是今文学，为刘歆所窜乱，及杂有古文说。

崔适年老体弱，口才不佳，1920年失业后搬离北大，住进湖州会馆。后经钱玄同设法，崔适于1922年回北大预科上课，1923年因不能上讲台而只能改作文。1924年8月，崔适客死京城，钱玄同设法筹钱为其办理后事。钱玄同又通过参与古史辨运动，扩大了崔适的学术影响力。