凡工程估修、核销及工料定价、收储，工关木税、苇税、通州三处地基租银等，亦归其掌理。设郎中六人（满四人，蒙、汉各一人）， 员外郎五人（满四人， 汉一人），主事五人（满、汉各二人，蒙一人），另有笔帖式等官。下设都城、营造、柜、砖木、杂、夫匠六科及案房、算房、火房等，分办本司事务。附属机构有皇木厂、木仓、琉璃窑，均以司员充任监督。另设司库负责收发黄蓝布城，并收掌所负责收发之楸棍、绳斤、麻刀等物料。