办事处成立于2002年。2009年11月，根据盟编委《关于调整巴彦浩特镇街道办事处管理体制的批复》（阿机编发[2009]11号）和《阿左旗巴彦浩特街道办事处机构改革实施方案（阿左党办发[2009]150号）》文件精神，办事处从巴镇管辖范围中划分出来，为旗委、旗政府派出机构，机构规格为正科级。