平凉南站建于1995年。

2022年11月，《新建铁路平凉至庆阳线环境影响报告书征求意见稿》发布，项目建设标准、线路走向和设站方案基本确定。中卫至平凉铁路扩能改造工程对既有车场进行适应性改建，在此基础上，平庆铁路接入平凉南站于站房侧增设1条到发线，平凉南站设12条到发线(含正线)，3 条调车线，另预留3条调车线，有效长度1050m，宝鸡端咽喉预留西平二线引入条件。