建校初期，大学只有3个系，今天已经成为拥有临床医学系、基础医学系、高丽医学系、卫生学系、口腔学系、药学系和90多个教研室、临床医学研究所、基础医学研究所、遗传医学研究所、病毒研究所的医学技术综合基地。大学加强理论教育，同时密切结合实践教育，做到学生学以致用。平壤医科大学附属医院有30多个专科、20多个辅助诊断治疗科和药房，供学生进行实习。学生们还到高丽医学科学院、平壤妇产医院、保健省皮肤病预防院、保健省口腔综合医院等平壤和各地医院去进行实习。 该大学还拥有实习厂、平壤制药厂、药草农场。 教师的实力就是学生的实力。