1968年5月，“文化大革命”中平潭县人民检察院撤销，被平潭县人民保卫组取代。

1979年4月，复设平潭县人民检察院，业务归莆田地区人民检察分院领导。同时，成立平潭县检察委员会。院内设5个科室。1983年5月，业务划归福州市人民检察院领导。1990年，内设机构增至8个科室。1994年，内设机构增至12个科室。共有干警55人，其中代检察长1人，副检察长1人，检察员28人，助理检察员8人，以及书记员、法警等。