主要围绕工业生物技术的核心－发酵与酶工程应用技术，以新生物质能源和化工产品开发为工程目标，结合生物信息学、分子进化技术、组合微生物技术和新型发酵技术开发，完善酶分子进化－工程菌筛选－催化过程（发酵优化为一体）的高通量、高效率工业生物催化体系筛选、优化及产业化技术体系，重点解决研究体系中工业生物技术中的理论问题。