庄孝僡研究成体组织器官对胚胎细胞诱导作用的专一性，以及诱导作用与胚胎区域性的相互关系，证明成体器官存在着性质不同的诱导因素。研究有尾类躯干后部尾部的发育，指出这二者的形成是通过原肠期之后的形态建成运动，对两栖类胚胎的中胚层的化分及发育机制做了系统的研究。对无神经幼虫开展的肢体再生的研究，证明无神经肢体的再生与正常幼虫没有区别。在国际上首次以无神经幼虫为模型，发现两栖类胚胎的表皮的细胞是可兴奋的，并且具有传播兴奋的能力。1946年—1950年，研究有尾两栖类胚胎形体演变等。1951年—1964年，从事胚胎诱导和分化方面的研究，证明神经系统区域分化是由于中胚层诱导物质和神经诱导物质的比值逐步变化所致，并观察到反应外胚层的胚龄、诱导物质作用时间的长短和浓度的不同，都能影响由诱导产生的组织的种类和数量。用电生理技术研究了表皮的兴奋传导与分化的关系，证明胚胎表皮细胞兴奋性的产生和消失受到中胚层因素的诱导影响，并从超微结构研究表明，表皮的兴奋传导可能与细胞表面间隙连接的结构特征有关。

[1]庄孝僡. 蝾螈胚胎中影响耳囊发育的因素[J]. 实验生物学报，1959（04）：67-101.

[2]庄孝僡. 哺乳类肝脏中胚层诱导物质的研究Ⅱ.酒精及热处理对诱导能力的影响[J]. 实验生物学报，1963（03）：108-127.

[3]庄孝僡，曾弥白. 蝾螈神经胚时期各种中胚层构造的决定和分化以及它们的发育机制[J]. 实验生物学报，1956（02）：145-228+249-263.

[4]庄孝僡，武玮璘，孙以安. 蝾螈胚胎表皮兴奋性和传导能力的出现和消失[J]. 实验生物学报，1982（04）：103-111.

[5]庄孝僡，武玮璘，孙以安. 关于有尾类非典型胚胎表皮的传导能力[J]. 实验生物学报，1982（03）：7-15.

[6]庄孝僡，武玮璘，孙以安. 中胚层在有尾类胚胎表皮传导中的作用(简报)[J]. 实验生物学报，1983（02）：126-130.

[7]戴荣禧，庄孝僡. 关于Rohon-Beard细胞的功能发育及其与胚胎早期行为的关系[J]. 实验生物学报，1986（03）：98-107.

庄孝僡在北京辅仁大学、中法大学、浙江大学、复旦大学、上海科技大学和中国科技大学等高校讲课，培养了大批组织胚胎学、细胞生物学方面的人才，多人成为各个岗位上的骨干力量和学术带头人，如细胞生物学家王亚辉教授等。

庄孝僡强调科研人员应重视理论逻辑思维修养，才能有敏锐的洞察力和加深对客观事物的深邃的理解，才能正确而有效地解决各种科学问题，以及解决生产中更深层次的问题。

庄孝僡妻子曾弥白，是中国科学院动物研究所研究员。

“他（庄孝僡）对中国细胞生物学作出的贡献，他的治学态度和为科学的献身精神，永远是我们学习的榜样。”（《实验生物学报》编辑部评）

“有远见的科学家往往有一些共同点，他们对学科的发展经常能结合自己经验的积累，提出一些超前的而别人没有想到的设想。庄先生（庄孝僡）就是这样一位科学家。”（细胞生物学家翟中和院士评）

“为了他（庄孝僡）数十年不顾外界的艰辛，促进和丰富了两栖类发育生物学所做出的贡献。”（纪念庄孝僡获得博士学位50周年，德国慕尼黑大学颁发给他的博士荣誉证书上的题词）