1984年，任华南农业大学昆虫生态研究室主任。

1997年，当选为中国科学院院士。

2004年3月25日，在广州逝世，享年75岁。

庞雄飞对害虫生态控制的理论和方法进行了长期研究工作。改进和发展生命表方法，提出种群控制指数作为定量研究各类因子作用的“算子”，建立害虫天敌及其与其他因子协同作用的研究方法，建立适应于种群控制研究的状态空间方程，打下了种群生态控制研究方法的基础。在天敌生物多样性的研究中，系统整理中国的瓢虫科，描述瓢虫、赤眼蜂和缨小蜂100多个新种，对其中的重要天敌的利用进行了研究。提出植物免害工程和植物保护剂概念，开创了植物保护学的全新研究领域。通过对中国南岭地区生物多样性及其保育和环境保护的论证，促成国家级森林公园和自然保护区的建立。

1984年，庞雄飞规划建立了华南农业大学昆虫生态研究室；1989年组织建立了农业部昆虫生态、毒理重点开放实验室。

截至2004年3月，庞雄飞共发表学术论文150余篇，出版学术专著18部，代表论著有《害虫种群系统控制》《系统科学在植物保护研究中的应用》《中国经济昆虫（二）瓢虫科》《系统科学在植物保护研究中的应用》《中国经济昆虫志小蜂总科》《天敌昆虫图册》《水稻害虫天敌图说》《全国瓢虫学术讨论会论文集》等。代表论文有《南岭山地生物群落简史》等。

庞雄飞与赵善欢、刘秀琼等学科骨干一起，规划建设了华南农业大学昆虫学科，庞雄飞并成为学科带头人。昆虫学科于1984年被国务院学位委员会评为博士点，1989年被评为国家级重点学科，在2002年和2007年继续被评为国家级重点学科。

庞雄飞主编参编的教材有《昆虫群落生态学》《昆虫学通论》《害虫生物防治》《农业昆虫学》等。

截至2004年3月，庞雄飞指导培养博士生29名，硕士生35名，他们已成为各自工作单位的骨干，如华南农业大学教授梁广文，安徽农业大学副教授党向利等。

庞雄飞出身于教育世家，父亲庞之鉴，母亲卢慕娲同为小学教师。家族自曾祖父以下有30人从事教育工作，母亲更是终身从事小学教育。庞雄飞在兄妹3人中排行第二。1939年，庞雄飞父亲病逝，母亲一人挑起了办学和养家的重担。庞雄飞与兄长在上学的同时，租田耕种帮助母亲养家。

庞雄飞的妻子李丽英曾任广东省科学院广东昆虫研究所研究员、所长等职。庞雄飞夫妇育有一子一女，儿子庞志，女儿庞虹。庞虹继承了父母的事业，已成长为昆虫学家。

“庞雄飞为科学和教育事业作出了卓越的贡献，为后人树立了光辉的榜样。”（华南农业大学教育基金会评）

“庞雄飞在害虫生态控制和天敌物种多样性及其利用方面做出了开拓性贡献。”（《昆虫分类学报》编辑部评）

“庞雄飞学术造诣深厚、成就卓著，他在多个领域做出了开拓性的重要贡献，在国际国内享有盛誉。”（华南农业大学评）

2009年11月，华南农业大学院士雕塑广场落成。中华人民共和国成立以来8名曾伴随着华农成长的院士塑像，永久“落户”华南农业大学，庞雄飞雕像位列其中。

“庞雄飞院士基金”由华南农业大学在2010年设立，每年从中国国内45岁以下的昆虫生态学和农业昆虫学研究或推广示范作出贡献的青年科技工作者中推选出一位获奖者，每两年颁奖一次，旨在推动昆虫学研究与害虫防治科技发展，表彰昆虫学与害虫防治领域政治思想、科学道德和学风好、做出贡献的中青年科技工作者。