异颖芨芨草为多年生，须根细韧而较稀疏。秆直立，丛生，高30-65厘米，径0.8-1毫米，具2-3节，基部膝曲。叶鞘紧密裹茎，常短于节间，无毛或上部常具微毛；叶舌膜质，长0.5-1毫米，先端截平或具裂齿；叶片直立，纵卷如线形，长4-12厘米；基生者长达20厘米，宽1-2毫米，无毛或上面生微毛。圆锥花序较狭窄，长7-13厘米，宽约1厘米，分枝细弱，斜向上升，长0.5-3厘米，短枝于基部即生小穗，小穗柄短，密生短毛；小穗淡绿色或灰白色；颖膜质，披针形，先端渐尖，具3脉，上部及中脉粗糙，第一颖长7-8毫米，第二颖长5-6毫米；外稃长3-4毫米，背部密被短柔毛，其近顶端之毛长3-4毫米，先端微2裂，具3脉，脉于顶端汇合，基盘钝圆而短，长约0.3毫米，具短毛，芒细弱，长1.5-2厘米，下部1/3-1/4处弯曲而不明显扭转；内稃等长或略短于外稃，具2脉，脉间被微毛，无脊；雄蕊3，花药长2-2.5毫米，顶端无毛；雌蕊的花柱不明显。花果期7-9月。