弗里德里克·夏洛特是普鲁士国王弗里德里希·威廉二世与第一任妻子不伦瑞克-沃尔芬比特尔的伊丽莎白·克里斯蒂娜·乌尔丽克的女儿。这对夫妻是表兄妹，他们于1769年离婚。

父母离婚后，母亲被流放到什切青，弗里德里克在她的祖母不伦瑞克-沃尔芬比特尔的路易丝·阿玛莉和继母黑森-达姆施塔特的弗里德里克·路易丝（她父亲的第二任妻子）的照顾下长大。

她于1791年9月29日在夏洛滕堡嫁给英国王子约克和奥尔巴尼公爵弗雷德里克·奥古斯塔斯。1791年11月23日，第二次婚礼在白金汉宫举行。弗里德里克跟随丈夫来到萨里郡的韦布里奇，夫妇住在奥特兰兹宅，该宅于1794年被烧毁，并以新哥特式历史主义风格重建。虽然公爵于1793年被任命为英国汉诺威军队司令，1795年被任命为英军元帅和总司令，但很快就与妻子分居，全身心投入到情妇玛丽·安妮·克拉克的怀抱，她一直在那里居住了近30年，直到去世，在此期间，她成为了一位慷慨的慈善家。