2000年，被省政府授予“河北省有突出贡献的中青年专家”称号。

2005年，被国务院批准为“享受政府特殊津贴专家”。

2007年，被河北省委命名为“第五批省管优秀专家”。

2008年，被评为“河北省首届名中医”，并被国家中医药管理局确定为“十一五”重点中医专科带头人。

2009年，被河北省政府授予“河北省劳动模范”称号；

2011年中共河北省委授予“河北省优秀党务工作者” 称号，并被评为河北省首届百名“白求恩式好医生十大标兵”；

2012年，荣获由国家中医药管理局颁发的“国家临床重点专科和学科带头人”称号；

2014年，荣获由河北省人民政府颁发的“河北省杰出专业技术人才”称号。

2015年”全国先进工作者“荣誉称号获得者。

中华中医药学会眼科分会副主任委员，河北省中医药学会常务理事、眼科分会副主任委员，河北省中西医结合眼科专业委员会副主任委员，《中华现代眼科学杂志》、《河北中医》杂志常务编委，国家药品价格审专家，国家科技进步奖评审专家，河北省专业技术职务任职资格高级评审委员会评委。

从事眼科临床科研工作37年来，在中医、中西医结合诊治疑难危重眼病方面有较高的学术造诣，特别是在治疗疑难眼底病、葡萄膜炎、干眼症等复杂眼病方面积累了丰富的临床经验，创立了“目络理论”，研制了“活血通络颗粒”、“玄麦润目颗粒”等6种治疗疑难眼病的中药制剂。获国家发明专利3项，获省部级科技进步奖7项（其中二等奖3项），承担国家自然科学基金、省基金等项目13项（其中国家自然科学基金3项）。发表学术论文104篇（其中SCI收录12篇），主编、参编著作12部。

张铭连从医30余年来，在中医、中西医结合诊治疑难危重眼病方面积累了丰富的临床经验，在临床、教学和科研工作中做出了较为突出的贡献。在眼科临床和科研实践中，他坚持“中体西用、继承创新。”中医为体，西医为用，在诊疗上坚持“能中不西、先中后西，中西医结合”的原则。以中医眼科理论为指导、用现代医学先进技术作支撑，打造中医特色眼科。有5项成果获省科技进步二、三等奖；获国家发明专利2项，主编、参编著作10部，其中有《眼科学》和《中西医结合眼科学》五年本科教材；发表论文80篇，被SCI收录4篇。创建了“河北省中医眼科研究所”和“河北省眼科学重点实验室”，承担国家和省级科研支撑计划及自然基金课题9项；所领导的眼科被评为“河北省重点学科”，中医眼科被评为国家临床重点专科和重点学科建设单位。

特别是在中医诊治眼病方面，张铭连不断开展新技术新疗法，把现代医学的新技术和中医的辨证施治相结合，并作为中医药治疗疑难眼病进行科研、判定疗效的标准，创立了“目络瘀阻”的论点，开发研制了“活血通络颗粒”等6种中药制剂。其“活血通络颗粒的研制及治疗缺血性眼病应用研究”获2012年河北省科技进步二等奖，成为全省眼科医院中最高奖项，并在河北省2012度科学技术奖励大会作为获奖代表上台领奖，受到省长张庆伟的接见。2014年张铭连成功申请国家自然科学基金项目2项，其中主持研究的“基于目络瘀阻探讨活血通络利水法干预视网膜Müller细胞水液代谢的分子机制” 项目（批准号81473733）获支持资金74万元。参与研究的“修饰因子在Leber遗传性视神经病变中作用的研究” 项目（批准号31471191）获支持资金85万元，实现了邢台市医疗卫生系统在国家级自然科学基础性研究科研项目上“零”的突破。

张铭连院长主持研究的6项科研成果，有4项获河北省科学技术进步奖，其中“慢性甲醇中毒性视神经病变的临床研究”被国内知名眼科专家、教授认为是填补了该研究领域的国内外空白，达到国际先进水平；“视康颗粒治疗视神经萎缩的临床及实验研究”被权威专家鉴定为居国内同类研究领先水平。参与编写专业书籍4部。创建了“河北省中医眼科研究所”，所领导的中医眼科先后被评为“邢台市重点学科”，“河北省重点中医专科”、国家中医药管理局“十一五”重点专科建设单位。

张铭连院长曾多次应邀到新加坡眼科中心、中国中医科学院眼科医院和北京中医药大学东方医院等进行学术讲座。现承担“活血通络颗粒的研制及治疗缺血性眼病的研究”、“止血明目颗粒治疗出血性眼病的临床研究”和“Leberi遗传性视神经病变的基因诊断，3N省级科研项目，在临床、教学和科研工作中做出了突出的贡献。