1962年，徐根宝升至南京部队足球队一线队，出任主力边后卫，并且在北京举行的甲级联赛中表现出色。不过，在1963年底到1964年初，徐根宝的球员生涯迎来巨大挑战，他在一场比赛中弄伤了膝盖，其半月板严重受伤，在要不要做手术的选择中，当时南京部队体工队大队长拍板不做手术，徐根宝进而参加了1964年联赛，在该赛季中，徐根宝帮助南京部队足球队杀回甲组，而他凭借着出色的表现，获得了八一队的关注。1965年，徐根宝继续表现出色，在该赛季帮助南京部队足球队取得了第6名。随后，徐根宝最终被最终一纸调令，调进了部队系统的运动员最高殿堂八一队。受限于时代环境，刚刚加入八一队的徐根宝，就陷入无球可踢的境地，当时全国联赛已经进入停摆状态，直到1972年才再次恢复。1974年，徐根宝跟随八一队获得了全国联赛冠军。1975年，由于伤病原因，徐根宝结束了自己长达14年的足球生涯。

1966年，徐根宝首次入选国家队，1973年参加国际友谊赛时，他被时任国家队年维泗任命为国家队队长。 由于时代环境所限，徐根宝于1975年就早早退役。他共代表中国队在正赛中出场7次，没有进球。

退役之后，徐根宝走上了教练岗位。1976年，徐根宝出任北京体育馆业余体校足球队教练。1978年--1979年 山西省足球队主教练，1979年带领山西省队历史性地打进了第四届全运会八强。1980年，徐根宝成为火车头体协足球队主教练，此后，1982年他又执教了云南省队，并在1983年短暂作为曾雪麟的助手加入国家足球队教练班子。后来，也是受到恩师年维泗的启发，积累了一些地方队带队经验后的徐根宝于1984年至1986年赴北京体院读书深造，弥补专业知识。

1986年12月，徐根宝成为国家二队主教练，该队是为国家队输送人才、备战1990年北京亚运会的目标。期间，徐根宝率领国家二队参加甲A联赛，其中在1989年夺得联赛冠军。1989年12月31日，在国家二队基础上成立了中国国奥队，徐根宝成为了这支球队的主教练。1991年，徐根宝率领中国国奥队冲击1992年巴塞罗那奥运会入场券，在出征吉隆坡前，他放出了“横下一条心，拼死要出线”的豪言，但在与韩国国奥队的比赛中，中国国奥队9分钟连丢3球，加上西亚球队联手做局，中国国奥队最终与巴塞罗那奥运会无缘。兵败吉隆坡后，徐根宝下课。1992年，徐根宝再次成为中国队助理教练，成为中国队第一任外教施拉普纳的教练班子成员，并于1993年离职。

1993年底，徐根宝拿起了上海申花的教鞭，率队征战甲A联赛。1994年4月17日，在甲A联赛第1轮中，徐根宝迎来了执教生涯甲A处子秀，他率领上海申花客场3-2击败沈阳六药。在1994赛季中，徐根宝率领上海申花在甲A联赛中取得10胜6平6负的成绩，获得了第3名。1995赛季，徐根宝率队卷土重来，他带着范志毅、申思、谢晖和祁宏等名将，高举“抢逼围”，在甲A联赛中豪夺十连胜，最终取得了14胜4平4负的佳绩，夺得冠军。在中国足协杯赛场上，徐根宝的带队成绩同样出色，他带领上海申花连续击败天津三星、四川全兴和广州宏远后杀进决赛，但在冠军争夺战中0-2负于山东泰山，无缘冠军。年底，在中国超级杯（超霸杯）上，上海申花与山东泰山再战，徐根宝带队1-0成功复仇夺冠。险些在1995赛季夺得三冠王的徐根宝，凭借着出色的带队成绩，当选甲A赛季最佳主教练。

1996赛季，徐根宝率领上海申花三线出击。在甲A联赛中，上海申花在赛季中期遭遇七连平，最终取得10胜9平3负，由于平局过多，最终以7分劣势屈居亚军；在中国足协杯赛场上，上海申花止步于第3轮，被大连万达挡在四强之外。在亚俱杯赛场上，上海申花在第2轮中不敌城南一和，两回合总比分0-1出局。 赛季结束后，徐根宝离开上海申花，三个赛季，他带队出战82次，取得44胜21平17负。

1997年初，徐根宝成为甲B球队广州松日主教练，并率队冲上甲A。赛季结束后，徐根宝离开广州松日，他在1997赛季带队出战26场比赛，取得10胜8平8负，其中在中国足协杯赛场上打进第3轮。

1998年2月19日，徐根宝拿起大连万达的教鞭。3月12日，徐根宝迎来了执教新球队处子秀，在中国超级杯中，大连万达1-2负于北京国安，无缘冠军。3月22日，在甲A联赛第1轮中，徐根宝迎来了执教新球队联赛首秀，他率领大连万达客场2-0击败之前一个赛季执教的广州松日。在联赛前7轮中，徐根宝带队取得6胜1平不败成绩，直到第8轮才遭遇甲A赛季首败，大连万达客场0-1不敌四川全兴。此后，大连万达在徐根宝的带领下不可阻挡，最终以19胜5平2负、积62分的成绩夺得甲A冠军，且比第二名上海申花高出17分之多，如此佳绩，让徐根宝第二次当选甲A最佳主帅。在中国足协杯赛场上，徐根宝率领大连万达杀进四强，但两回合与辽宁天伦战平后，点球大战落败无缘决赛。

1999赛季，由于头号球星禁赛，队长徐弘等老将相继因伤缺阵，加之外援引进不利，大连万达成绩遭遇巨大滑坡。1999年12月5日甲A末轮大连万达实德1-0客胜申花，仅排名第9。而且在中国超级杯中输给了上海申花，徐根宝帅位岌岌可危。尽管联赛成绩不佳，但徐根宝仍要分心其他战线，因为此时大连万达已经在亚俱杯走到最后阶段，他们4月开赴中国香港参加亚俱杯四强的赛事，并在半决赛中2-0击败波斯波利斯。4月5日，在亚俱杯决赛中，徐根宝率领大连万达与浦项制铁鏖战120分钟0-0战平，最终他们在点球大战中5-6落败，无缘冠军。 此后，回归甲A赛场的大连万达成绩继续无起色，1999年5月，徐根宝辞去大连万达队主教练，改任有名无实的总教练。在执教大连万达期间，徐根宝带队出战50场比赛，成绩为28胜15平7负。

2000年11月，徐根宝成为上海中远主教练。在徐根宝的带领下，上海中远在甲B赛场上所向披靡，在22场比赛中，取得了14胜4平4负的成绩，积46分，以4分优势夺得联赛冠军，并升入甲A联赛。赛季结束后，徐根宝没有继续执教上海中远。短短一年时间里，徐根宝带队出战23场比赛，取得14胜4平5负。

2001年12月，徐根宝离开上海中远后，再次拿起上海申花的教鞭。2002年3月2日，在中国超级杯第2回合中，徐根宝率领上海申花2-0击败大连实德，从而3-1夺冠。这是徐根宝第二次执教上海申花为数不多的亮点。3月9日，在甲A联赛第1轮中，上海德比打响，徐根宝率领上海申花迎战他之前一个赛季执教的上海中远，最终上海申花主场0-1败北。该场比赛，徐根宝成为焦点，因为关系不佳的缘故，申思在帮助上海中远获胜后，公开“叫板”徐根宝。由于成绩不佳，徐根宝在赛季中期下课。执教期间，徐根宝带队出战12次，取得3胜2平7负。

2005年12月25日，上海东亚（集团）有限公司、上海根宝足球基地有限公司共同出资成立上海东亚足球俱乐部。随后，徐根宝成为该足球俱乐部董事长和主席。2007赛季，徐根宝亲自挂帅，率领上海东亚征战中乙联赛。 在徐根宝的带领下，上海东亚先是在中乙北区联赛中取得9胜3平2负的成绩，夺得第一名，进而获得了参加中乙总决赛的资格。 在中乙总决赛阶段，徐根宝先是带领上海东亚在第3轮两回合中3-2险胜安徽九华山，然后在决赛中2-1击败四川队，夺得冠军，同时获得中甲联赛参赛资格。

2009年，徐根宝率领上海足球队夺得山东全运会U20男足组别冠军。4年后，徐根宝作为上海男足全运队总教练，力助时任主帅的成耀东率队夺得2013年辽宁全运会U20男足组别冠军。2017年，在天津全运会上，徐根宝作为教练班子一员，帮助上海队夺得男足U18组别冠军。2023年5月，徐根宝确认第四次率领上海队出征2025年粤港澳大湾区全运会。

徐根宝妻子名叫李丽芬，她曾是国家游泳队队员，他们夫妇有一个儿子。

1999年夏天，徐根宝决定开一所足球学校，为中国足球培养人才，并将学校地址选在崇明岛。2000年6月1日，崇明根宝基地奠基，上海根宝足球学校正式拉开序幕。2002年，由于足球学校开销太大，徐根宝在巨大的经济压力下，拿起了上海申花的教鞭，他在职业足球俱乐部得到的薪酬，用来补贴足球学校的资金缺口。就是在如此恶劣环境下，徐根宝一步步将这所足球学校办了起来。如今，这所足球学校，至今已经开办20余年，培养了武磊、颜骏凌和张琳芃等国脚。

2015年11月13日，足坛名宿徐根宝将在西班牙东南部的穆尔西亚地区洛尔卡市签署协议，收购西乙B联赛洛尔卡足球俱乐部，并准备在这座西班牙所辖面积第二大的城市打造一座类似“拉玛西亚”的足球基地，在欧洲足球的核心地区再造“崇明根宝模式”，并以此真正圆他培养世界级球星之梦。这一创举，也得到了上海市有关领导的认可和支持。

2017年5月28日，徐根宝控股的洛尔卡在2016-17赛季西乙B升级附加赛首轮第二回合的比赛中主场0-0阿尔瓦塞特，凭借着客场进球多的优势晋级，成功升入下赛季西乙联赛。这是洛尔卡自成立以来，第一次有机会征战西乙联赛。

2017年11月16日，徐根宝在中国足坛再竖大旗，他在“新起航——崇明根宝足球俱乐部签约仪式”宣布，将以2017年全运会男足U18冠军队为班底，以朱辰龙等6位现役国青主力为核心，打造新一代“青年军”，征战中国足球联赛，2018年先参加城市联赛，如果顺利，可以打当年丙级联赛冲击乙级。

2013年11月18日，受聘为上港集团足球俱乐部总顾问。

2017年9月28日，出任上海市足协顾问。

2018年1月，被中国足协任命为男足全国青训总监。1月31日，中国足球协会青训中心授牌及青训总监聘书颁发仪式举行，徐根宝受聘为青训顾问。

徐根宝是一个非常迷信的人，他信命，信缘分。执教如此，选拔人才也是一样。他的球星选拔战略有着严格规范，不仅球技好，人品好，连长得不好也得打负分。（搜狐体育 评）

徐根宝带出了高洪波、范志毅、武磊等优秀球员，2018年，上海上港夺得中超冠军，结束了恒大在中国职业足球顶级联赛七年称霸的历史。不论是作为球员还是作为教练，或是投身于青训事业，徐根宝都在中国足坛留下了浓墨重彩的一笔。（江苏卫视 评）