微生物（主要是指细菌、藻类、原生动物等）是地球上最早的生命物质，也是地球表层强大的地质营力之一。在微生物地球化学作用下，地球表层的碳、氢、氮、氧、镁、铝、硅、磷、硫、钾、钙、钽、钒、锰、铁、钴、镍、铜、锌、砷、钼、银、金、铅、铀等几十种元素的分异、迁移、富集和形成矿床。如天然气、黄铁矿、大洋锰结核、金矿、铜矿、铀矿、叠层石、磷块岩、碳酸盐岩等等。