德州市人民检察院设办公室、人事处、组织教育处、新闻宣传办公室、第一检察部、第二检察部、第三检察部、第四检察部、第五检察部、第六检察部、第七检察部、第八检察部、法律政策研究室、案件管理办公室、检务督察办公室、检察业务保障部、检察事务保障部等17个内设机构，信息中心等1个事业单位，共111人。下辖德城、陵城、乐陵、禹城、平原、齐河、夏津、武城、临邑、宁津、庆云、开发区等12个县(市、区)检察院。

德州市人民检察院在省委、市委和上级检察机关的坚强领导下，深入学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想，牢牢把握“讲政治、顾大局、谋发展、重自强”的总体要求和“稳进、落实、提升”的工作主题，忠实履行各项检察职能，着力强化法律监督主业，着力服务保障大局，着力深化改革创新，着力打造过硬检察队伍，不断开创全市检察工作新局面。市人民检察院先后荣获全省政法系统创人民满意活动先进单位、全国检察机关减刑、假释、暂予监外执行专项检察活动先进集体、全国青少年普法教育先进单位，全国检察机关文明接待室等荣誉称号11项，被德州市委、市政府授予平安德州建设先进单位、全市安保维稳工作先进单位等荣誉称号8项。被最高检、省检察院记集体一等功3次，二等功4次。武城县院、齐河县院、乐陵市院、临邑县院先后被评为全国先进基层检察院。先后涌现出全国五一劳动奖章获得者、齐鲁时代楷模、全国模范检察官黄平亮、全国检察机关先进个人曹晓梅等一批先进典型。