一般说来，承压地下水埋藏深，受气候的直接影响小，流量稳定，水质也比较好，不易受污染，是很好的供水水源。如果承压地下水补给区的自然条件遭到破坏，水源补给有了变化，那么承压区自流水的流量和水质都将受到影响，而这种影响不是一时所能觉察到的，往往需要一段时间才能看出来。因此，对自流水的补给区的自然环境要很好的保护，使其免遭破坏和污染。

承压水的补给区往往很远，如果在承压区过量开采地下水，地下水位下降形成漏斗区之后，补给非常困难，就会造成很大危害。