拜多亚在索马里语中发音比较接近“拜达伯”。原来是索马里过渡议会所在地。

当地的有力氏族组成了一个索马里和解与恢复委员会(SRRC)，该会于2002年4月1日于拜多亚树立了自治政府，在西南索马里的支配之下，被定为“首都”。但2003年5月拜多亚（Baidoa）易手。

2009年被“青年党”攻占，2012年2月被埃塞俄比亚支持索马里军队夺回。

2012年4月，非盟特派团在拜多亚部署了100名布隆迪和乌干达士兵，这是非盟部队第一次部署到摩加迪沙以外地区。

2012年4月17日，发生自杀炸弹袭击，致1名士兵死亡。