更新时间：2024-08-17 19:36
通过了中央庭新指挥使选拔的普通少年（少女）。
他虽然没有使用神话武器的能力，但是拥有极为罕见的辅助能力
强化、治愈、净化、觉醒……拥有一切辅助力量的少年成为神器使们依赖的对象。
结识了多名神器使，拥有了许多伙伴，少年为了守护城市而奔走在战场上。
但在他深入接触了这一切之后，却发现事情远比表面上的复杂。
……威胁并不仅仅只是怪物而已……只有自己才能看到（希罗也看得见）的“7天”倒计时，正在一点点吞噬这个城市。
一般主线
一周目时，指挥使正在参加中央庭新指挥使选拔的考核。最终通过考试当选为新的指挥使，可之后就晕了过去，醒来之后除了自己的名字以外忘却了所有有关交界都市的记忆。后时间进入倒计时第7天。
第7天
当指挥使“你”醒来时，第一个看到就是安和安托涅瓦。安托涅瓦会对指挥使讲述中央庭，战斗终端，神器使等等基础知识。中途安托涅瓦有事离开，吩咐安给失忆的指挥使介绍交界都市的详细情况。
安给指挥使介绍了指挥使到来前城市的状况，城市中被黑门侵占的地区，指挥使的任务，初代指挥使希罗等。但此时中央庭出现了异常状况，安立刻带着指挥使去破坏黑门，指挥使顺便还得到了中央庭的黑核（一周目。二周目直接净化了黑核），之后安托涅瓦出现，询问指挥使是否加入中央庭，如果拒绝（三周目起可选）的话将无法攻略安和安托涅瓦。
第6天
安会亲自催促指挥使起床，并为指挥使做了丰盛的早餐。之后两人同去巡查高校学园。却发生了赛哈姆活骸化的事件。指挥使从希罗口中得知，安托涅瓦极力主张消灭活骸。当指挥使想要找办法阻止赛哈姆的活骸化进程时，安和希罗回答活骸化是不可逆的过程。希罗希望指挥使对安托涅瓦保密赛哈姆的活骸化，以让自己找出治疗她的方法。回到中央庭汇报后，可以选择告诉安托涅瓦真相，指挥使会询问她是否真的定下了这条规定，而她承认了，并告诉了指挥使与第一个活骸对战的事情。其中那个失去双腿的神器使，可能就是她自己。
在指挥使离开后，安托涅瓦发现希罗送来的战斗记录有问题，向神秘人（有可能就是少女神明）求助后，她发现真相竟然是希罗夺取了赛哈姆的幻力结晶使赛哈姆力量衰弱而变成活骸。愤怒的安托涅瓦传送到了希罗的研究所（如果这时候指挥使也在，她会带着指挥使和安一起传送进房间），但最终希罗用研究价值以及自己初代指挥使的身份，斥退了安托涅瓦，而且方舟内指挥使没能了解到情况。
如果指挥使回到中央庭向安托涅瓦报告完毕以后选择去见希罗，安会在希罗的据点等候指挥使。此时活骸化的赛哈姆暴走，安使用时间技能想让赛哈姆稳定下来，却差点被杀死，场面一度失控，最终活骸化赛哈姆被安托涅瓦杀死。
第5天
安托涅瓦召集了中央庭的七人众，并公开了希罗导致赛哈姆活骸化的事情。然而7人众中早有4人已经归于希罗阵营，希罗到场，引发冲突。双方激战后，希罗撤退，而安托涅瓦因为过度使用力量，身体开始活骸化，被送入治疗中心。而希罗加快了夺取各未解放区的黑核进程。
第4天
由于中央庭的分裂和安托涅瓦开始活骸化，再加上希罗在电视媒体里大肆宣传所谓的“新世界融合论”，导致许多神器使投奔了希罗，晏华主持大局，身体稍微稳定的安托涅瓦进行了一些文书工作。指挥使问她身体状况时，她表示可能只有“奇迹”才能让身体恢复，指挥使也当场许下了找到奇迹的诺言。
第3天
安出现在了希罗的据点，希罗责怪安办事不利，跟指挥使相处的时光让她似乎拥有了不该有的情感。安向希罗保证这一次一定会完成任务便离开了。此时出现了一个神秘女孩的声音，通过她与希罗的对话可知，记录赛哈姆活骸化过程的真正录像是她提供给安托涅瓦的，她和希罗之间是合作关系。
安作为希罗方神器使的身份已经暴露，她回到中央庭，潜入病房想要攻击安托涅瓦。结果被前来看望安托涅瓦的指挥使发现，慌忙逃走。
如果指挥使选择追上去，安会对指挥使说她其实是希罗方在中央庭的卧底，只是一个人偶，现在已经被发现了，她很快就会被“处理”掉。最后离开了，指挥使也责怪自己为什么没能在有限的时间里更加了解安。
如果指挥使选择留下来照看安托涅瓦，指挥使会和她有一段对话。
第2天
安托涅瓦已经快到了极限。如果选择帮助她解脱，指挥使会在冲出病房后看到来夺取安托涅瓦活骸化身体的，达尔维拉和被洗脑的安。指挥使正惊愕时，晏华告诉他这个安已经不是原来的安了。剧情战一触即发，胜利后安会带着达尔维拉逃走下落不明（可能被希罗处理掉了），但还是保住了中央庭的黑核。之后指挥使会命令晏华去追击安和达尔维拉，这几天以来发生的事使指挥使成长了起来。
如果安托涅瓦自我了断，指挥使会因为犹豫被洗脑后的安刺中，重伤濒死。在迷糊中看到了安的幻象，虽然后被神秘女孩打断并强制复活，但是达尔维拉还是在一片混乱中夺走了中央庭的黑核。
第1天
最大黑门已经敞开。