卑尔根大学在1825年建立的卑尔根博物馆的基础上创建于1946年。创办时设有医学院、数学与自然科学院和人文学院。

1970年，设立牙医学院（并入医学院）和社会科学学院。

1980年，设立心理学院和法学院。

卑尔根大学有着广泛的学术交流和校际联系，国际关系办公室是负责与外界合作和交流的主要机构。1977年以来，该校每年派出一定数量的教师和学生出国进修和深造，同时邀请外国学者前来讲学。该校与20多个国家的大学建立了交流和合作关系，如中国的外交学院，加拿大的纽芬兰纪念大学（互派研究生和教师）、美国西雅图的华盛顿大学（互派教师）、加利福尼亚大学（互派学生）和俄勒冈大学（互派学生），法国的卡昂大学（互派师生），德国的基尔克里斯蒂安·阿尔布雷希特大学（互派教师），荷兰的乌得勒支大学（互派师生），苏丹的喀土穆大学（互派师生和合作科研），尼泊尔加德满都特里布万大学（互派师生和合作科研），坦桑尼亚的达累斯萨拉姆大学（互派师生和合作科研），哥斯达黎加大学（互派师生）。