乾隆四十七年(1782年)和五十九年(1794年),书院又经两次修建,春风楼改建为敬业堂,并增建后轩、穿堂、后斋、左右书室。书院聘请社会名流和饱学宿儒讲学、授课,其主旨是使读书弟子研究举业,并旁及其他实用学术。书院发膏火银,资助、奖励学习。沪上“诸生多在肄业”,“他邑亦有负笈而来者,海上文风??乎日上矣”(杨魁《重修书院记》)。道光年间,两江总督陶澍题“果行育德”匾,江苏巡抚林则徐题“海滨邹鲁”匾。咸丰十一年(1861年),老天主堂地产归还法国天主教会,翌年书院迁聚奎街旧学宫。同治十年(1871年)起兼作考棚,每年两次县考。光绪三十一年(1905年)改称上海县立敬业高等小学。民国年间先后成为县立第一高等小学、初级中学、市立中学。