清雍正十一年（1733），程乡升格为直隶嘉应州，统领兴宁、长乐、平远、镇平4县加上本属的程乡县称“嘉应五属”，直属广东省辖。

嘉庆十二年（1807）升嘉应州为嘉应府。

嘉庆十七年复为嘉应州，仍领兴宁、长乐、平远、镇平四县。

宣统三年（1911），嘉应州复名梅州。

民国3年（1914）废州府制，梅州改名梅县。

中华人民共和国成立后，1949年10月设置兴梅专区；

1950年1月26日，设置兴梅行政督察专员公署，辖梅县、兴宁、五华、大埔、丰顺、蕉岭、平远7县；

1952年底，撤销兴梅专区，兴梅7县改隶粤东行政区；

1956年2月，粤东行政区划分为惠阳专区、汕头专区，兴梅7县属汕头专区；

1965年7月，设立梅县专区，原兴梅7县从汕头专区分出，归属梅县专区，后改为梅县地区；

1979年3月，原梅县所辖之梅州镇由区级升格为县级称梅州市，梅县地区辖7县1市；

1983年6月，梅州市与梅县合并改为梅县市，梅县地区由所辖7县1市改为6县1市；

1988年1月，广东实行市管县体制，梅县地区改为梅州市，辖原兴梅7县及新划县级区梅江区，共7县1区；

1994年6月，兴宁县撤县设市（县级），梅州市辖梅江区、梅县、平远县、蕉岭县、大埔县、丰顺县、五华县，代管兴宁市（县级）。

2013年10月，经国务院同意批准梅州市梅县撤县设区，从此梅县结束了县治，设立梅州市梅县区。梅州辖梅江区、梅县区、兴宁市、大埔县、丰顺县、五华县、平远县、蕉岭县2区1市5县。

清以前，梅州各县行政区划设置不尽相同。程乡县在唐代称乡、里。全县划分为怀仁、光德、丰顺、逢福、万安、太平等6乡。宋熙宁间改乡、里为都、保。元丰废都、保而复乡、里。元代改乡、里为都、图。宋、元代乡里、都图数多少无考。至明代改设厢、都制，附郭（即城内附城）为厢，野居（城外乡村）为都，厢、都下为图，图下为里。明初程乡设3厢9都，下辖19图、190里，置平远县时，划出义化、长田、石窟三都四图，置镇平县时划出松源之第二图，龟浆之第二图。置丰顺县时划出万安之第三图第五里（即万安都径心、环清、建桥三堡），至清乾隆，全县尚存3厢6都、13图139里。清乾隆改称保、甲、约（有的亦称社、卒、宫、村），嘉应本属（程乡县）划为36堡，下辖224个约或甲、社。

兴宁县明代分东南西北4厢，下辖171村。清代仍有4厢，但将村改为堡，共154堡。

五华县在宋熙宁四年置长乐县时，有厢、都设置，附城为厢，其外为都，厢、都再分为图，以图统乡。全县设1厢、3都（即清化、洑溪、琴江）、9图（清化3图、濮溪2图，琴江4图），下分52乡。至明隆庆三年（1569），分为南、北2厢，3都依旧，以下分10图、37乡。清末2厢3都设置依旧，但都以下改设4楼、24约，下辖496村。

大埔县在明嘉靖三十六年（1557）有都、社设置，置清远、滦洲2都，都以下设32社。清乾隆九年（1744）改社、甲设置，分为3社17甲，社甲为自主单元，不相统属。

平远县在明嘉靖建置初至清初，均设都、图、里，全县设4都、19图，清顺治十七年（1660）改为乡、都、堡，设2乡4都15堡，清康熙二十三年（1684）废都、堡，改设15乡，嘉庆二十五年（1820）再改为4都、15乡、195村。

蕉岭县在明崇祯六年（1633）割程乡的龟浆二图、松源二图、平远县的石窟一图、二图置镇平县。建县后，县以下区划为乡、社制，全县设12乡、84社。清代沿用明制，乡、社数与明代同。

清代各县行政区划设置如下：

程乡县分36堡：西街、东街、西厢、东厢、水南、白土、罗衣、龙文（原名龙岗）、大立、小立、榄潭、柴黄、畲坑、扶贵、长滩、南口、锦屏（原名小乍）、河田、四都、瑶上、石坑（原名下）、李坑、大坪、石扇、西阳（曾称四场）、丙村（曾称锦洲）、金盘、雁洋、松口、大竹、梅屏（原名下半图）、嵩山、隆文（原名龙牙）、尧塘、桃源、松源。

兴宁县设东、南、西、北四厢。东厢辖35堡，南厢辖36堡，西厢辖42堡，北厢辖41堡.共154堡。

五华县设南、北二厢，清化、洑溪、琴江3都，东、南、西、北4楼，下辖496村。

大埔县在清乾隆九年（1744）设清远、滦洲二都，都以下设同仁、大麻、三河3社，兰沙、古源、百侯、白寨、岩上、源高、大产、长富、石上、在城、永兴、维新、保安、大宁、长治、永青、坪沙等17甲，社或甲以下设197村。

丰顺县在清末设丰政、蓝田、万安、清远4都，都以下设丰一、丰二、丰三、蓝九、蓝十、万三、附丰7图，图以下设38个乡、社、堡。

自南朝齐（479-502年）始置程乡县以后，不仅县、州、府的建置历有变更，且辖境亦有改变。

建程乡县时，县境包括今梅县、平远、蕉岭三县的全部和丰顺之一小部分，全境面积5000多平方公里。

明嘉靖四十一年（1562年）5月开设平远县，划程乡县的豪居林子营置平远县城。四十三年（1564年），增划程乡县西北境的义化都（今东石、坝头、大柘一带）、长田都（今长田、热柘、超竹一带）、石窟都（今泗水及蕉岭县石窟河一带）归平远。此时，程乡县境面积缩小1000多平方公里。

明崇祯六年（1633年）置镇平县（今蕉岭县），划程乡县的松源都第二图（今南、北标）、龟浆都第二图（今白渡与蕉岭交界处）归镇平，程乡县境面积又缩小近千平方公里。

清乾隆四年（1739年）置丰顺县，划程乡县的万安都第三图之小溪坝、环清、径心归丰顺县。县境面积减为2900多平方公里。

建国初，丰顺县的径心、义士、赤岭、叶田和蕉岭县的田心等村庄分别划归梅县畲江和松源。1956年和1966年，梅县石扇的黄竹坪划人平远县热柘乡，兴宁县的石岭和叶华先后划归梅县水车和径义乡。梅县县境面积增为3017.4平方公里。

1958年11月20日，蕉岭并人梅县，县境总面积增至近4000平方公里。1961年3月，蕉岭又复分出，县境面积复为3017.4平方公里。

1975年8月，梅城镇改为梅州镇建制，1978年12月30日从梅县分出，设置县级的梅州市（总面积46.3平方公里），梅县面积减为2971.1平方公里。1983年6月，梅县与梅州市合并为梅县市。至此，梅县全境面积复为3017.4平方公里。

从南齐置县起，县、州、府、专区、市治均在梅城。

隋朝，程乡县治在今西区更楼下。

宋代，梅州署在城内三桂坊（今梅城仲元东、西路衔接处以北）。

明洪武二年（1369年），废梅州，程乡县县治由更楼下迁于城内州署（梁伯聪《梅县风土二百咏》有云:“程乡官署迹寻求，曾井东隅旧址留，隋代筑成明徙位，土名犹自号更楼。”原诗注:“今更楼下叶屋侧、朱屋背，仍存一墙，厚二尺余，乡人谓为旧程乡县之废址云”）。洪武十五年（1382年），建程乡县治于城内东南隅，后改建于城内西南隅。

清顺治三年（1646年），县署移建于北门原察院行署旧址。是年，县署毁。顺治十年（1653年）重建程乡县署于原州署旧址。清雍正十一年（1733年），程乡升为直隶嘉应州，以原程乡县署为州署（即今梅城仲元东、西路衔接处）。民国时期，梅县县政府驻地仍设于此。

建国后，1949年至1983年，梅县人民政府驻地设于民国时期的梅县县政府驻地。1983年，梅县市人民政府机关迁于梅城江南一路。

附：县、州名称来历考

梅县从南齐建县以来，先后有过程乡、敬州、梅州、嘉应州、嘉应府、梅县、梅县市#县、州、府、市名称。其来历考释如下：

程乡县 南齐置县时，名程乡。据《光绪嘉应州志·沿革》引《方舆纪要》云:“南齐置程乡县，时有程受·者，以信义行于乡，因名，属义安郡。”

敬州 南汉刘晟乾和三年，即后晋开运二年（945年），程乡县境设敬州。据北宋乐史《太平寰宇记》注:“敬州或作恭州，非恭州，乃宋避庙讳而称”（见《光绪嘉应州志》）。但因何取名敬州，尚无史料可考。

梅州 北宋开宝四年（971年），平广南，灭南汉，因敬州的“敬”犯宋太祖赵匡胤的祖父赵敬之讳，改敬州为梅州（见乐史《太平寰宇记》、王象之《舆地纪胜》），这是梅州一名使用之始。何以称“梅州”？据《光绪嘉应州志·山川》载:“梅峰在城西门外（今西郊），五峰错落，似梅花五片，故名，……梅峰、梅溪，此地山水，宋改敬州为梅州，本以山水得名。”

嘉应州 清雍正十一年（1733年）三月，程乡县升为直隶嘉应州，钦定州名为嘉应。嘉应州之得名是因在梅城东门外（今梅州文化公园左侧），于南宋淳熙年间（1174年--1189年）建有“嘉应桥”，因而得名。清《乾隆嘉应州志·桥渡》载:“雍正十一年升程乡为直隶州，钦定州名嘉应，此桥（指嘉应桥）若先兆焉。”《光绪嘉应州志·序》:“秦开五岭，东为揭阳，讫于南齐，肇有程乡，曰敬曰梅，雄镇一方，赐名嘉应，桥兆其祥。”

梅县 民国元年（1912年），废除州府制改称梅县。因北宋、南宋、元朝沿用过梅州之名，1911年11月，嘉应州光复，一度复名梅州，故废州改县时称为梅县。