斛律孝卿少时聪敏机悟，有风度，多任显职。武平末年，任侍中、开府仪同三司，封义宁王，知内省事，掌管外兵、骑兵机密。当时，朝纲日乱，政归宦官。自赵彦深死后，朝廷主持机密的大臣，只有斛律孝卿一个人独守清白，没有贪秽。

北齐后主高纬到齐州，任命斛律孝卿为尚书令，又任命中书侍郎薛道衡为侍中，封北海王。二人劝后主作承光主诏书，禅位给叔父任城王高湝。后主令斛律孝卿携带诏策以及传国玺前往瀛州。斛律孝卿抵达都城邺城（今河北临漳县）后，将诏策和传国玺送给北周武帝宇文邕，居住长安（今陕西西安），出任纳言上士。

隋开皇年间，位至太府卿、山南道行台仆射，卒于民部尚书任上。

《北齐书·卷二十·列传第十二》有记载。

父亲：斛律羌举，东魏东夏州刺史，赠恒州都督