新安江南铁路货运站2013年5月开工建设，至2016年3月竣工，工期34个月，总投资4.27亿元，占地面积350亩，站内设到发线5股、货物线2股、专用线2股，设计年运输能力300万吨，主要办理批量零散货物快运、整车、集装箱等到达发送业务。该货运站建成启用的同时，铁路金千线上的更楼、寿昌、新安江等3个货运站撤销。

2016年4月8日，建德市新安江南货运站正式开通运营，浙江西部安全、快速、便捷、经济、绿色的铁路物流通道，又一次实现扩容、扩能。

新安江南货运站的建成启用，在上海铁路局新货运站、货场建设运营管理方面开创了‘六个第一’，这为今后铁路货运站、货场建设提供了有益的借鉴。该货运站在建设中，对仓库和地面首次同步采用无尘化处理；所有仓库屋顶，首次采用光伏太阳能用电；“前店”与“后场”生产调度，首次采取集中统一指挥；货运站生活后勤保障，首次实行“一体化管理”。